Francis Ndungu

African-specific genetic loci determine iron status and risk of severe malaria and bacteremia in African children.Muriuki, J. M. Mentzer, A. J. Band, G. Chong, A. Y. Macharia, A. W. Mogire, R. M. Abuga, K. M. Mitchell, R. Gilchrist, J. J. Webb, E. L. Ndungu, F. M. Raffield, L. M. Ekunwe, L. Bentley, A. R. Sirima, S. B. Madhi, S. A. Hill, A. V. S. Prentice, A. M. Bejon, P. Hemani, G. Smith, G. D. Sandhu, M. S. Elliott, A. M. Williams, T. N. Adeyemo, A. Atkinson, S. H.
Nat Commun, (2026). :

Pre-COVID-19 ex vivo cross-reactive IFN-gamma cellular response to SARS-CoV-2 spike overlapping peptides is more prevalent among Kenyan compared to Swedish adults.Wanjiku, P. Orindi, B. Mwacharo, J. Chemweno, J. Karanja, H. K. Kronsteiner, B. Kai, O. Wright, D. Ochola-Oyier, L. I. Sundling, C. Dunachie, S. Warimwe, G. M. Farnert, A. Bejon, P. Ndungu, F. M. Nduati, E. W.
BMC Infect Dis, (2026). 26:174

Induction of an early IFN-gamma cellular response and high plasma levels of SDF-1alpha are inversely associated with COVID-19 severity and residence in rural areas in Kenyan patients.Wanjiku, P. Orindi, B. Kimotho, J. Sayed, S. Shah, R. Saleh, M. Mwacharo, J. Maronga, C. Olouch, V. Karanu, A. Shah, J. Nneka, Z. Ochola-Oyier, L. I. Abdi, A. I. Dunachie, S. Bejon, P. Nduati, E. W. Ndungu, F. M.
PLoS One, (2025). 20:e0316967

OSBPL11 is an African-specific locus associated with 25-hydroxyvitamin D concentrations and cardiometabolic health.Mogire, R. M. Muriuki, J. M. Bayimenye, R. F. Mentzer, A. J. Chong, A. Gouveia, M. H. Bentley, A. R. Band, G. King'ori, P. Mitchell, R. Webb, E. L. Sengupta, D. Ekunwe, L. Ndungu, F. M. Morovat, A. Macharia, A. W. Cutland, C. L. Hemani, G. Sirima, S. B. Ramsay, M. Figueiredo, C. A. Prentice, A. M. Madhi, S. A. Raffield, L. M. Sandhu, M. S. Bejon, P. Smith, G. D. Elliott, A. M. Williams, T. N. Rotimi, C. Bourne, C. R. Burgett, A. Adeyemo, A. Atkinson, S. H.
medRxiv, (2025). :

Development of an oral regimen of unithiol for the treatment of snakebite envenoming: a phase 1 open-label dose-escalation safety trial and pharmacokinetic analysis in healthy Kenyan adults.Abouyannis, M. Nyambura, Y. K. Ngome, S. Riako, D. Musyoki, J. Muiruri, C. Orindi, B. Else, L. Amara, A. Dickinson, L. Clare, R. H. Albulescu, L. O. Westhorpe, A. P. Kool, J. Adetifa, I. Ndungu, F. M. FitzGerald, R. Khoo, S. Lalloo, D. G. Casewell, N. R. Hamaluba, M.
EBioMedicine, (2025). 113:105600

Kinetics of naturally induced binding and neutralising anti-SARS-CoV-2 antibody levels and potencies among SARS-CoV-2 infected Kenyans with diverse grades of COVID-19 severity: an observational study.Kimotho, J. Sein, Y. Sayed, S. Shah, R. Mwai, K. Saleh, M. Wanjiku, P. Mwacharo, J. Nyagwange, J. Karanja, H. Kutima, B. Gitonga, J. N. Mugo, D. Karanu, A. Moranga, L. Oluoch, V. Shah, J. Mutiso, J. Mburu, A. Nneka, Z. Betti, P. Usyu Mutinda, W. Abdi, A. I. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Warimwe, G. M. Nduati, E. W. Ndungu, F. M.
Wellcome Open Res, (2025). 8:350

Evaluation of copromicroscopy, multiplex-qPCR and antibody serology for monitoring of human ascariasis in endemic settings.Mugo, R. M. Rausch, S. Musimbi, Z. D. Strube, C. Raulf, M. K. Landt, O. Gichuki, P. M. Ebner, F. Mwacharo, J. Odiere, M. R. Ndungu, F. M. Njomo, D. W. Hartmann, S.
PLoS Negl Trop Dis, (2024). 18:e0012279

Correlations between three ELISA protocols measurements of RTS,S/AS01-induced anti-CSP IgG antibodies.Mugo, R. M. Orindi, B. Shee, F. M. Bellamy, D. Mwacharo, J. Ewer, K. J. Bejon, P. Ndungu, F. M.
PLoS One, (2023). 18:e0286117

Transcriptomic signatures induced by the Ebola virus vaccine rVSVDeltaG-ZEBOV-GP in adult cohorts in Europe, Africa, and North America: a molecular biomarker study.Vianello, E. Gonzalez-Dias, P. van Veen, S. Engele, C. G. Quinten, E. Monath, T. P. Medaglini, D. Vsv-Ebovac Consortium Vsv-Eboplus Consortium Santoro, F. Huttner, A. Dubey, S. Eichberg, M. Ndungu, F. M. Kremsner, P. G. Essone, P. N. Agnandji, S. T. Siegrist, C. A. Nakaya, H. I. Ottenhoff, T. H. M. Haks, M. C.
Lancet Microbe, (2022). 3:e113-e123

Vitamin D Deficiency and Its Association with Iron Deficiency in African Children.Mogire, R. M. Muriuki, J. M. Morovat, A. Mentzer, A. J. Webb, E. L. Kimita, W. Ndungu, F. M. Macharia, A. W. Cutland, C. L. Sirima, S. B. Diarra, A. Tiono, A. B. Lule, S. A. Madhi, S. A. Prentice, A. M. Bejon, P. Pettifor, J. M. Elliott, A. M. Adeyemo, A. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
Nutrients, (2022). 14:

TRUE-1: Trial of Repurposed Unithiol for snakebite Envenoming phase 1 (safety, tolerability, pharmacokinetics and pharmacodynamics in healthy Kenyan adults).Abouyannis, M. FitzGerald, R. Ngama, M. Mwangudzah, H. Nyambura, Y. K. Ngome, S. Riako, D. Babu, L. Lewa, F. Else, L. Dily Penchala, S. Orindi, B. Mumba, N. Kalama, B. Ndungu, F. M. Adetifa, I. Khoo, S. Lalloo, D. G. Casewell, N. R. Hamaluba, M.
Wellcome Open Res, (2022). 7:90

Plasmodium falciparum-Specific Memory B-Cell and Antibody Responses Are Associated With Immunity in Children Living in an Endemic Area of Kenya.Jahnmatz, P. Nyabundi, D. Sundling, C. Widman, L. Mwacharo, J. Musyoki, J. Otieno, E. Ahlborg, N. Bejon, P. Ndungu, F. M. Farnert, A.
Front Immunol, (2022). 13:799306

10-year longitudinal study of malaria in children: Insights into acquisition and maintenance of naturally acquired immunity.Addy, J. W. G. Bediako, Y. Ndungu, F. M. Valetta, J. J. Reid, A. J. Mwacharo, J. Ngoi, J. M. Wambua, J. Otieno, E. Musyoki, J. Said, K. Berriman, M. Marsh, K. Bejon, P. Recker, M. Langhorne, J.
Wellcome Open Res, (2022). 6:79

Chronic Immune Activation and CD4(+) T Cell Lymphopenia in Healthy African Individuals: Perspectives for SARS-CoV-2 Vaccine Efficacy.Wolday, D. Ndungu, F. M. Gomez-Perez, G. P. de Wit, T. F. R.
Front Immunol, (2021). 12:693269

Prevalence and predictors of vitamin D deficiency in young African children.Mogire, R. M. Morovat, A. Muriuki, J. M. Mentzer, A. J. Webb, E. L. Kimita, W. Ndungu, F. M. Macharia, A. W. Cutland, C. L. Sirima, S. B. Diarra, A. Tiono, A. B. Lule, S. A. Madhi, S. A. Sandhu, M. S. Prentice, A. M. Bejon, P. Pettifor, J. M. Elliott, A. M. Adeyemo, A. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
BMC Med, (2021). 19:115

Malaria is a cause of iron deficiency in African children.Muriuki, J. M. Mentzer, A. J. Mitchell, R. Webb, E. L. Etyang, A. O. Kyobutungi, C. Morovat, A. Kimita, W. Ndungu, F. M. Macharia, A. W. Ngetsa, C. J. Makale, J. Lule, S. A. Musani, S. K. Raffield, L. M. Cutland, C. L. Sirima, S. B. Diarra, A. Tiono, A. B. Fried, M. Gwamaka, M. Adu-Afarwuah, S. Wirth, J. P. Wegmuller, R. Madhi, S. A. Snow, R. W. Hill, A. V. S. Rockett, K. A. Sandhu, M. S. Kwiatkowski, D. P. Prentice, A. M. Byrd, K. A. Ndjebayi, A. Stewart, C. P. Engle-Stone, R. Green, T. J. Karakochuk, C. D. Suchdev, P. S. Bejon, P. Duffy, P. E. Davey Smith, G. Elliott, A. M. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
Nat Med, (2021). 27:653-658

Atypical B cells are part of an alternative lineage of B cells that participates in responses to vaccination and infection in humans.Sutton, H. J. Aye, R. Idris, A. H. Vistein, R. Nduati, E. Kai, O. Mwacharo, J. Li, X. Gao, X. Andrews, T. D. Koutsakos, M. Nguyen, T. H. O. Nekrasov, M. Milburn, P. Eltahla, A. Berry, A. A. Kc, N. Chakravarty, S. Sim, B. K. L. Wheatley, A. K. Kent, S. J. Hoffman, S. L. Lyke, K. E. Bejon, P. Luciani, F. Kedzierska, K. Seder, R. A. Ndungu, F. M. Cockburn, I. A.
Cell Rep, (2021). 34:108684

Iron Deficiency Is Associated With Reduced Levels of Plasmodium falciparum-specific Antibodies in African Children.Bundi, C. K. Nalwoga, A. Lubyayi, L. Muriuki, J. M. Mogire, R. M. Opi, H. Mentzer, A. J. Mugyenyi, C. K. Mwacharo, J. Webb, E. L. Bejon, P. Williams, T. N. Gikunju, J. K. Beeson, J. G. Elliott, A. M. Ndungu, F. M. Atkinson, S. H.
Clin Infect Dis, (2021). 73:43-49

Malaria exposure drives both cognate and bystander human B cells to adopt an atypical phenotype.Aye, R. Sutton, H. J. Nduati, E. W. Kai, O. Mwacharo, J. Musyoki, J. Otieno, E. Wambua, J. Bejon, P. Cockburn, I. A. Ndungu, F. M.
Eur J Immunol, (2020). 50:1187-1194

Estimating the burden of iron deficiency among African children.Muriuki, J. M. Mentzer, A. J. Webb, E. L. Morovat, A. Kimita, W. Ndungu, F. M. Macharia, A. W. Crane, R. J. Berkley, J. A. Lule, S. A. Cutland, C. Sirima, S. B. Diarra, A. Tiono, A. B. Bejon, P. Madhi, S. A. Hill, A. V. S. Prentice, A. M. Suchdev, P. S. Elliott, A. M. Williams, T. N. Atkinson, S. H.
BMC Med, (2020). 18:31