Publications

Philip Bejon

A Pragmatic Trial of Glucocorticoids for Community-Acquired Pneumonia.Lucinde, R. K. Gathuri, H. Mwaniki, P. Orindi, B. Otieno, E. O. Mwakio, S. Mulemi, L. Isaaka, L. Shangala, J. Saisi, M. Isinde, E. Oginga, I. N. Wachira, A. W. Manuthu, E. Kariuki, H. Asaava, P. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. M. Lusamba, W. Muthui, B. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Aliyan, N. A. Gituma, B. Matiko, M. G. Omondi, C. A. Ombajo, L. A. Kirui, N. Ochola, L. Abdi, A. I. Kagucia, E. W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, I. Kamuya, D. Bejon, P. Barasa, E. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
N Engl J Med, (2025). 393:2187-2197

Controlled human malaria infection studies: insights into recent advances and key immunological and ethical implementation lessons.Ogwang, R. Adan, M. Bejon, P. Kapulu, M. C.
Front Immunol, (2025). 16:1672945

Assessing the Impact of SARS-CoV-2 Spike Mutations on Antibody Binding: A Comparative Assessment of the Wuhan and JN.1 Variants' Full-Length Spikes in a Multiplex Luminex Assay.Waweru, G. Nyakundi, R. Kutima, B. Owuor, S. Konyino, G. Gitonga, J. Lugano, D. Maina, A. Musyoki, J. Ochola, L. Omondi, M. Kariuki, C. K. Ogongo, P. Mwachari, C. Shee, F. Agoti, C. Sande, C. Uyoga, S. Kagucia, E. Agweyu, A. Bejon, P. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
Viruses, (2025). 17:

Induction of an early IFN-gamma cellular response and high plasma levels of SDF-1alpha are inversely associated with COVID-19 severity and residence in rural areas in Kenyan patients.Wanjiku, P. Orindi, B. Kimotho, J. Sayed, S. Shah, R. Saleh, M. Mwacharo, J. Maronga, C. Olouch, V. Karanu, A. Shah, J. Nneka, Z. Ochola-Oyier, L. I. Abdi, A. I. Dunachie, S. Bejon, P. Nduati, E. W. Ndungu, F. M.
PLoS One, (2025). 20:e0316967

Genomic and clinical epidemiology of SARS-CoV-2 in coastal Kenya: insights into variant circulation, reinfection, and multiple lineage importations during a post-pandemic wave.Lambisia, A. W. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Gallagher, K. Mutunga, M. Nyale, E. Omungala, J. Mwanga, M. Murunga, N. Nyiro, J. Nyagwange, J. Sande, C. Bejon, P. Githinji, G. Dellicour, S. Phan, M. V. T. Cotten, M. Ochola-Oyier, L. I. Holmes, E. C. Agoti, C. N.
BMC Glob Public Health, (2025). 3:80

Making MALDI-TOF MS for entomological parameters accessible: A practical guide for in-house library creation.Karisa, J. Tuwei, M. Ominde, K. Bartilol, B. Ondieki, Z. Musani, H. Rono, M. Mbogo, C. Bejon, P. Mwangangi, J. Wanjiku, C. Maia, M.
PLoS One, (2025). 20:e0330605

R21/Matrix-M malaria vaccine drives diverse immune responses in pre-exposed adults: insights from a phase IIb controlled human malaria infection trial.Kibwana, E. Bundi, C. Kimani, D. Nyamako, L. Keter, K. Mutiso, A. Ogwang, R. Bellamy, D. Rapi, K. Bajer, A. Provstgaard-Morys, S. Stockdale, L. Munoz, O. Datoo, M. S. Lawrie, A. Ramos-Lopez, F. Roberts, R. Hamaluba, M. Hill, A. V. S. Bejon, P. Ewer, K. J. Kapulu, M.
Front Immunol, (2025). 16:1620365

Vaccine-induced responses to R21/Matrix-M - an analysis of samples from a phase 1b age de-escalation, dose-escalation trial.Bundi, C. Bellamy, D. Kibwana, E. Nyamako, L. Ogwang, R. Keter, K. Kimani, D. Salman, A. M. Provstgaard-Morys, S. Stockdale, L. Hill, A. V. S. Bejon, P. Olotu, A. Hamaluba, M. Ewer, K. J. Kapulu, M. C.
Front Immunol, (2025). 16:1620366

Emergence and transmission dynamics of the FY.4 Omicron variant in Kenya.Musundi, S. Mwanga, M. Lambisia, A. Morobe, J. M. Murunga, N. Moraa, E. Ndwiga, L. Cheruiyot, R. Musyoki, J. Mutunga, M. Guzman-Rincon, L. M. Sande, C. Mwangangi, J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N. Nyiro, J. Githinji, G.
Virus Evol, (2025). 11:veaf035

OSBPL11 is an African-specific locus associated with 25-hydroxyvitamin D concentrations and cardiometabolic health.Mogire, R. M. Muriuki, J. M. Bayimenye, R. F. Mentzer, A. J. Chong, A. Gouveia, M. H. Bentley, A. R. Band, G. King'ori, P. Mitchell, R. Webb, E. L. Sengupta, D. Ekunwe, L. Ndungu, F. M. Morovat, A. Macharia, A. W. Cutland, C. L. Hemani, G. Sirima, S. B. Ramsay, M. Figueiredo, C. A. Prentice, A. M. Madhi, S. A. Raffield, L. M. Sandhu, M. S. Bejon, P. Smith, G. D. Elliott, A. M. Williams, T. N. Rotimi, C. Bourne, C. R. Burgett, A. Adeyemo, A. Atkinson, S. H.
medRxiv, (2025). :

COVID-19 mortality in Africa and Asia - Authors' reply.Bejon, P. Agweyu, A. Oyier, I. Hamaluba, M. Kamuya, D. Kinyanjui, S. Barasa, E.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:e440

Protein-specific immune response elicited by the Shigella sonnei 1790GAHB GMMA-based candidate vaccine in adults with varying exposure to Shigella.Randall, A. Z. Conti, V. Nakakana, U. Liang, X. Teng, A. A. Di Pasquale, A. L. Kapulu, M. Frenck, R, Jr. Launay, O. Ferruzzi, P. Scire, A. S. Marchetti, E. Obiero, C. Pablo, J. V. Edgar, J. Bejon, P. Shandling, A. D. Campo, J. J. Yee, A. Martin, L. B. Podda, A. Micoli, F.
mSphere, (2025). 10:e0105724

Rethinking the evidence on COVID-19 in Africa.Bejon, P. Agweyu, A. Ochola-Oyier, L. I. Hamaluba, M. Kamuya, D. Kinyanjui, S. Barasa, E.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:e463-e471

Low-Dose Yellow Fever Vaccine in Adults in Africa.Kimathi, D. Juan-Giner, A. Bob, N. S. Orindi, B. Namulwana, M. L. Diatta, A. Cheruiyot, S. Fall, G. Dia, M. Hamaluba, M. M. Nyehangane, D. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Omuoyo, D. O. Hussein, M. Oloo, E. Kamau, N. Wafula, J. Bendera, J. Silvester, N. Mwavita, J. Joshua, M. Mwendwa, J. Agababyona, C. Ngetsa, C. Aisha, N. Moki, F. Buluku, T. Munene, M. Mwanga-Amumpaire, J. Lutwama, J. Kayiwa, J. Kamaara, E. Barrett, A. D. Kaleebu, P. Bejon, P. Sall, A. A. Grais, R. F. Warimwe, G. M. Nifty Investigators
N Engl J Med, (2025). 392:788-797

Detection of low frequency artemisinin resistance mutations, C469Y, P553L and A675V, and fixed antifolate resistance mutations in asymptomatic primary school children in Kenya.Osoti, V. Wamae, K. Ndwiga, L. Gichuki, P. M. Okoyo, C. Kepha, S. Keitany, K. Kandie, R. Aricha, S. Kiplagat, R. Mwandawiro, C. Bejon, P. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
BMC Infect Dis, (2025). 25:73

Linking Cerebral Malaria Pathogenesis to APOE-Mediated Amyloidosis: Observations and Hypothesis.Kioko, M. Mwangi, S. Njunge, J. M. Berkley, J. A. Bejon, P. Abdi, A. I.
Mol Neurobiol, (2025). 62:1720-1725

Comparative performance of the InBios SCoV-2 Detect (TM) IgG ELISA and the in-house KWTRP ELISA in detecting SARS-CoV-2 spike IgG antibodies in Kenyan populations.Kutima, B. Kagucia, E. W. Mwai, K. Kimani, M. Sigilai, A. Mugo, D. Karanja, H. Gitonga, J. N. Karani, A. Akech, D. Toroitich, M. Karia, B. Tuju, J. Ziraba, A. K. Bigogo, G. Ochieng, C. Onyango, C. Lidechi, S. Munywoki, P. K. Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Oyier, L. I. O. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Nyagwange, J. Kenya, Sars-CoV-Serology Consortium
Wellcome Open Res, (2024). 9:349

Evaluation of population immunity against SARS-CoV-2 variants, EG.5.1, FY.4, BA.2.86, JN.1, JN.1.4, and KP.3.1.1 using samples from two health demographic surveillance systems in Kenya.Lugano, D. Kutima, B. Kimani, M. Sigilai, A. Gitonga, J. Karani, A. Akech, D. Karia, B. Ziraba, A. K. Maina, A. Lambisia, A. Omuoyo, D. Mugo, D. Lucinde, R. Owuor, S. Konyino, G. Newman, J. Bailey, D. Nduati, E. Githinji, G. Agoti, C. N. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Kagucia, W. Warimwe, G. M. Sande, C. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
BMC Infect Dis, (2024). 24:1474

Identification of complex Plasmodium falciparum genetic backgrounds circulating in Africa: a multicountry genomic epidemiology analysis.Miotto, O. Amambua-Ngwa, A. Amenga-Etego, L. N. Abdel Hamid, M. M. Adam, I. Aninagyei, E. Apinjoh, T. Awandare, G. A. Bejon, P. Bertin, G. I. Bouyou-Akotet, M. Claessens, A. Conway, D. J. D'Alessandro, U. Diakite, M. Djimde, A. Dondorp, A. M. Duffy, P. Fairhurst, R. M. Fanello, C. I. Ghansah, A. Ishengoma, D. S. Lawniczak, M. Maiga-Ascofare, O. Auburn, S. Rosanas-Urgell, A. Wasakul, V. White, N. F. D. Harrott, A. Almagro-Garcia, J. Pearson, R. D. Goncalves, S. Ariani, C. Bozdech, Z. Hamilton, W. L. Simpson, V. Kwiatkowski, D. P.
Lancet Microbe, (2024). 5:100941

Prospective clinical surveillance for severe acute respiratory illness and COVID-19 vaccine effectiveness in Kenyan hospitals during the COVID-19 pandemic.Lucinde, R. K. Gathuri, H. Isaaka, L. Ogero, M. Mumelo, L. Kimego, D. Mbevi, G. Wanyama, C. Otieno, E. O. Mwakio, S. Saisi, M. Isinde, E. Oginga, I. N. Wachira, A. Manuthu, E. Kariuki, H. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. Lusamba, W. Muthui, B. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Ahmed, N. Gituma, B. Giabe, M. Omondi, C. Aman, R. Amoth, P. Kasera, K. Were, F. Nganga, W. Berkley, J. A. Tsofa, B. Mwangangi, J. Bejon, P. Barasa, E. English, M. Scott, J. A. G. Akech, S. Kagucia, E. W. Agweyu, A. Etyang, A. O.
BMC Infect Dis, (2024). 24:1246