Isabella Ochola-Oyier

Transmission networks of SARS-CoV-2 in Coastal Kenya during the first two waves: A retrospective genomic study.Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Dellicour, S. Mohammed, K. S. Lambisia, A. W. de Laurent, Z. R. Morobe, J. M. Mburu, M. W. Omuoyo, D. O. Ongera, E. M. Ndwiga, L. Maitha, E. Kitole, B. Suleiman, T. Mwakinangu, M. Nyambu, J. K. Otieno, J. Salim, B. Musyoki, J. Murunga, N. Otieno, E. Kiiru, J. N. Kasera, K. Amoth, P. Mwangangi, M. Aman, R. Kinyanjui, S. Warimwe, G. Phan, M. Agweyu, A. Cotten, M. Barasa, E. Tsofa, B. Nokes, D. J. Bejon, P. Githinji, G.
Elife, (2022). 11:

Epidemiology of COVID-19 infections on routine polymerase chain reaction (PCR) and serology testing in Coastal Kenya.Nyagwange, J. Ndwiga, L. Muteru, K. Wamae, K. Tuju, J. Testing Team, C. Kutima, B. Gitonga, J. Karanja, H. Mugo, D. Kasera, K. Amoth, P. Murunga, N. Babu, L. Otieno, E. Githinji, G. Nokes, D. J. Tsofa, B. Orindi, B. Barasa, E. Warimwe, G. Agoti, C. N. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
Wellcome Open Res, (2022). 7:69

Amplicon Sequencing as a Potential Surveillance Tool for Complexity of Infection and Drug Resistance Markers in Plasmodium falciparum Asymptomatic Infections.Wamae, K. Kimenyi, K. M. Osoti, V. de Laurent, Z. R. Ndwiga, L. Kharabora, O. Hathaway, N. J. Bailey, J. A. Juliano, J. J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
J Infect Dis, (2022). 226:920-927

Targeted Amplicon Deep Sequencing for Monitoring Antimalarial Resistance Markers in Western Kenya.Osoti, V. Akinyi, M. Wamae, K. Kimenyi, K. M. de Laurent, Z. Ndwiga, L. Gichuki, P. Okoyo, C. Kepha, S. Mwandawiro, C. Kandie, R. Bejon, P. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
Antimicrob Agents Chemother, (2022). 66:e0194521

Optimization of the SARS-CoV-2 ARTIC Network V4 Primers and Whole Genome Sequencing Protocol.Lambisia, A. W. Mohammed, K. S. Makori, T. O. Ndwiga, L. Mburu, M. W. Morobe, J. M. Moraa, E. O. Musyoki, J. Murunga, N. Mwangi, J. N. Nokes, D. J. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Githinji, G.
Front Med (Lausanne), (2022). 9:836728

Comparative performance of WANTAI ELISA for total immunoglobulin to receptor binding protein and an ELISA for IgG to spike protein in detecting SARS-CoV-2 antibodies in Kenyan populations.Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Uyoga, S. Tuju, J. Ochola-Oyier, L. I. Ndungu, F. Bejon, P. Agweyu, A. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
J Clin Virol, (2022). 146:105061

Seroprevalence of Antibodies to Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Among Healthcare Workers in Kenya.Etyang, A. O. Lucinde, R. Karanja, H. Kalu, C. Mugo, D. Nyagwange, J. Gitonga, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Karani, A. Mutua, S. Maroko, H. Nzomo, E. Maitha, E. Kamuri, E. Kaugiria, T. Weru, J. Ochola, L. B. Kilimo, N. Charo, S. Emukule, N. Moracha, W. Mukabi, D. Okuku, R. Ogutu, M. Angujo, B. Otiende, M. Bottomley, C. Otieno, E. Ndwiga, L. Nyaguara, A. Voller, S. Agoti, C. N. Nokes, D. J. Ochola-Oyier, L. I. Aman, R. Amoth, P. Mwangangi, M. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Adetifa, I. M. O. Wangeci Kagucia, E. Gallagher, K. Uyoga, S. Tsofa, B. Barasa, E. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Warimwe, G. M.
Clin Infect Dis, (2022). 74:288-293

Anti-Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Immunoglobulin G Antibody Seroprevalence Among Truck Drivers and Assistants in Kenya.Kagucia, E. W. Gitonga, J. N. Kalu, C. Ochomo, E. Ochieng, B. Kuya, N. Karani, A. Nyagwange, J. Karia, B. Mugo, D. Karanja, H. K. Tuju, J. Mutiso, A. Maroko, H. Okubi, L. Maitha, E. Ajuck, H. Mukabi, D. Moracha, W. Bulimu, D. Andanje, N. Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Nyaguara, A. Voller, S. Otiende, M. Bottomley, C. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Adetifa, I. M. O. Etyang, A. O. Gallagher, K. E. Uyoga, S. Barasa, E. Bejon, P. Tsofa, B. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G. Magarini Sub-County Tda Sars-CoV-2 Serosurveillance Team, The Busia County T. D. A. Sars-CoV-Serosurveillance Team
Open Forum Infect Dis, (2021). 8:ofab314

COVID-19 transmission dynamics underlying epidemic waves in Kenya.Brand, S. P. C. Ojal, J. Aziza, R. Were, V. Okiro, E. A. Kombe, I. K. Mburu, C. Ogero, M. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Nyagwange, J. Karanja, H. Gitonga, J. N. Mugo, D. Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Otieno, E. Murunga, N. Otiende, M. Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N. Githinji, G. Kasera, K. Amoth, P. Mwangangi, M. Aman, R. Ng'ang'a, W. Tsofa, B. Bejon, P. Keeling, M. J. Nokes, D. J. Barasa, E.
Science, (2021). 374:989-994

Tracking the introduction and spread of SARS-CoV-2 in coastal Kenya.Githinji, G. de Laurent, Z. R. Mohammed, K. S. Omuoyo, D. O. Macharia, P. M. Morobe, J. M. Otieno, E. Kinyanjui, S. M. Agweyu, A. Maitha, E. Kitole, B. Suleiman, T. Mwakinangu, M. Nyambu, J. Otieno, J. Salim, B. Kasera, K. Kiiru, J. Aman, R. Barasa, E. Warimwe, G. Bejon, P. Tsofa, B. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N.
Nat Commun, (2021). 12:4809

Temporal trends of SARS-CoV-2 seroprevalence during the first wave of the COVID-19 epidemic in Kenya.Adetifa, I. M. O. Uyoga, S. Gitonga, J. N. Mugo, D. Otiende, M. Nyagwange, J. Karanja, H. K. Tuju, J. Wanjiku, P. Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Rombo, C. Yegon, C. Kithi, K. Odhiambo, E. Rotich, T. Orgut, I. Kihara, S. Bottomley, C. Kagucia, E. W. Gallagher, K. E. Etyang, A. Voller, S. Lambe, T. Wright, D. Barasa, E. Tsofa, B. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Agweyu, A. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
Nat Commun, (2021). 12:3966

The Plasmodium falciparum Rh5 invasion protein complex reveals an excess of rare variant mutations.Ndwiga, L. Osoti, V. Ochwedo, K. O. Wamae, K. Bejon, P. Rayner, J. C. Githinji, G. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2021). 20:278

A review of the frequencies of Plasmodium falciparum Kelch 13 artemisinin resistance mutations in Africa.Ndwiga, L. Kimenyi, K. M. Wamae, K. Osoti, V. Akinyi, M. Omedo, I. Ishengoma, D. S. Duah-Quashie, N. Andagalu, B. Ghansah, A. Amambua-Ngwa, A. Tukwasibwe, S. Tessema, S. K. Karema, C. Djimde, A. A. Dondorp, A. M. Raman, J. Snow, R. W. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
Int J Parasitol Drugs Drug Resist, (2021). 16:155-161

An open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 7,000 worldwide samples.MalariaGen, Ahouidi, A. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amaratunga, C. Amato, R. Amenga-Etego, L. Andagalu, B. Anderson, T. J. C. Andrianaranjaka, V. Apinjoh, T. Ariani, C. Ashley, E. A. Auburn, S. Awandare, G. A. Ba, H. Baraka, V. Barry, A. E. Bejon, P. Bertin, G. I. Boni, M. F. Borrmann, S. Bousema, T. Branch, O. Bull, P. C. Busby, G. B. J. Chookajorn, T. Chotivanich, K. Claessens, A. Conway, D. Craig, A. D'Alessandro, U. Dama, S. Day, N. P. Denis, B. Diakite, M. Djimde, A. Dolecek, C. Dondorp, A. M. Drakeley, C. Drury, E. Duffy, P. Echeverry, D. F. Egwang, T. G. Erko, B. Fairhurst, R. M. Faiz, A. Fanello, C. A. Fukuda, M. M. Gamboa, D. Ghansah, A. Golassa, L. Goncalves, S. Hamilton, W. L. Harrison, G. L. A. Hart, L. Henrichs, C. Hien, T. T. Hill, C. A. Hodgson, A. Hubbart, C. Imwong, M. Ishengoma, D. S. Jackson, S. A. Jacob, C. G. Jeffery, B. Jeffreys, A. E. Johnson, K. J. Jyothi, D. Kamaliddin, C. Kamau, E. Kekre, M. Kluczynski, K. Kochakarn, T. Konate, A. Kwiatkowski, D. P. Kyaw, M. P. Lim, P. Lon, C. Loua, K. M. Maiga-Ascofare, O. Malangone, C. Manske, M. Marfurt, J. Marsh, K. Mayxay, M. Miles, A. Miotto, O. Mobegi, V. Mokuolu, O. A. Montgomery, J. Mueller, I. Newton, P. N. Nguyen, T. Nguyen, T. N. Noedl, H. Nosten, F. Noviyanti, R. Nzila, A. Ochola-Oyier, L. I. Ocholla, H. Oduro, A. Omedo, I. Onyamboko, M. A. Ouedraogo, J. B. Oyebola, K. Pearson, R. D. Peshu, N. Phyo, A. P. Plowe, C. V. Price, R. N. Pukrittayakamee, S. Randrianarivelojosia, M. Rayner, J. C. Ringwald, P. Rockett, K. A. Rowlands, K. Ruiz, L. Saunders, D. Shayo, A. Siba, P. Simpson, V. J. Stalker, J. Su, X. Z. Sutherland, C. Takala-Harrison, S. Tavul, L. Thathy, V. Tshefu, A. Verra, F. Vinetz, J. Wellems, T. E. Wendler, J. White, N. J. Wright, I. Yavo, W. Ye, H.
Wellcome Open Res, (2021). 6:42

Seroprevalence of anti-SARS-CoV-2 IgG antibodies in Kenyan blood donors.Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Karanja, H. K. Nyagwange, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Rombo, C. Yegon, C. Kithi, K. Odhiambo, E. Rotich, T. Orgut, I. Kihara, S. Otiende, M. Bottomley, C. Mupe, Z. N. Kagucia, E. W. Gallagher, K. E. Etyang, A. Voller, S. Gitonga, J. N. Mugo, D. Agoti, C. N. Otieno, E. Ndwiga, L. Lambe, T. Wright, D. Barasa, E. Tsofa, B. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Agweyu, A. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
Science, (2021). 371:79-82

Characteristics of SARS-CoV-2 infections in households in rural coastal Kenya: a prospective genomic study..Agoti, C.N. Nyiro, J. Murunga, N. Lambisia, A.W. Mohammed, K.S. de Laurent, Z.R. Morobe, J.M. Mburu, M.W. Ndwiga, L. Ongera, E.M. Makori, T. Musyoki, J. Mwangangi, J. Tsofa, B. Ochola-Oyier, L. I. Bejon, P. Githinji, G. Nokes , D. J. Gallagher, K. E.
1st International Conference on Public Health in Africa (CPHIA-2021), (2021). :

Serosurveillance for SARS-CoV-2 Antibodies in a cohort of Health Care Workers in Kenya..Etyang, A. O. Lucinde, R. Gitonga, J. N. Kalu, C. Karani, A. Nyagwange, J. Mugo, D. Karanja, H. K. Tuju, J. Mutiso, A. Maroko, H. Okubi, L. Maitha, E. Mukabi, D. The HCW SARS-CoV-2 Serosurveillance Team, Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng’ang’a, W. Nyaguara, A. Voller, S. Otiende, M. Bottomley, C. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Adetifa, I.M.O. Gallagher, K. E. Uyoga, S. Barasa, E. Bejon, P. Tsofa, B. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G.
1st International Conference on Public Health in Africa (CPHIA), (2021). :

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Kenya: March 2020-October 2021..Githinji, G. Lambisia, W. A. Mohamed, K. S. Morobe, M. J. de Laurent, Z. R. Mburu, W. M. Ongera, M. E. Omuoyo, O. D. Ndwiga, L. Otieno, E. Murunga, N. Musyoki, J. KWTRP COVID Testing Team. Kilifi Rapid Response Team. Kiiru, J. Kasera, K. Amoth, P. Mwangangi, M. Aman, R. Kinyanjui, S. Warimwe, G. M. Agweyu, A. Barasa, E. Tsofa, B. Mwangangi, J. Matoke, D. Nokes, D. J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N.
1st International Conference on Public Health in Africa (CPHIA-2021), (2021). :

High anti-SARS-CoV-2 IgG antibody seroprevalence among long-distance trucking crews in Kenya within one year of the COVID-19 pandemic..Kagucia, E. W. Gitonga, J. N. Kalu, C. Kuya, N. Ochieng, B. Karia, B. Ochomo, E. Karani, A. Nyagwange, J. Mugo, D. Karanja, H. K. Tuju, J. Mutiso, A. Maroko, H. Okubi, L. Maitha, E. Mukabi, D. The TDA SARS-CoV-2 Serosurveillance Team. Aman, R. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Ng’ang’a, W. Nyaguara, A. Voller, S. Otiende, M. Bottomley, C. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Adetifa, I . M. O. Etyang, A. O. Gallagher, K. E. Uyoga, S. Barasa, E. Bejon, P. Tsofa, B. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G.
1st International Conference on Public Health in Africa (CPHIA), (2021). :

Comparative performance of WANTAI ELISA for total immunoglobulin to receptor binding protein and an ELISA for IgG to spike protein in detecting SARS-CoV-2 antibodies in Kenyan populations..Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Uyoga, S. Tuju, J. Ochola-Oyier, L. I. Ndungu, F. Bejon, P. Agweyu, A. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M.
1st International Conference on Public Health in Africa (CPHIA), (2021). :