clinicalresearch/Wellcome Open Res

Pf8: an open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 33,325 worldwide samples.Malaria Genomic Epidemiology, Network Abdel Hamid, M. M. Abdelraheem, M. H. Acheampong, D. O. Adam, I. Aide, P. Ajibaye, O. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amenga-Etego, L. Aniebo, I. Aninagyei, E. Ansah, F. Apinjoh, T. O. Ariani, C. V. Auburn, S. Awandare, G. A. Balmer, A. Bejon, P. Boene, S. Bwire, G. Candrinho, B. Chidimatembue, A. Chindavongsa, K. Comiche, K. Conway, D. Dara, A. Diakite, M. Djimde, A. Dondorp, A. Doumbia, S. Drury, E. Fanello, C. A. Ferdig, M. Figueroa, K. Gamboa, D. Golassa, L. Goncalves, S. Guindo, M. D. A. Hamaluba, M. Hanboonkunupakarn, B. Howe, K. Hussien, M. Imwong, M. Ishengoma, D. Jeans, J. Kabaghe, A. Kamuhabwa, A. Kindermans, J. M. Konate, D. S. Kwiatkowski, D. P. Lee, C. Lee, S. K. Lee, S. J. Ley, B. Llanos-Cuentas, A. Marfurt, J. Matambisso, G. Maude, R. R. Maude, R. J. Mayor, A. Mayxay, M. Maiga-Ascofare, O. McCann, R. S. Miles, A. Miotto, O. Mohamed, A. O. Morang'a, C. M. Murie, K. Ngasala, B. E. Nguyen, T. N. Nolasco, O. Nosten, F. Noviyanti, R. O'Connor, I. Oboh, M. Ochola-Oyier, L. I. Olufunke Falade, C. Olukosi, A. Olumide, A. Olusola, F. I. Onyamboko, M. A. Oriero, E. C. Oyibo, W. A. Pannebaker, D. Pearson, R. D. Phiri, K. van der Pluijm, R. W. Price, R. N. Quang, H. H. Rajkumar Devaraju, V. Randrianarivelojosia, M. Ranford-Cartwright, L. Rayner, J. C. Rovira-Vallbona, E. Rowlands, K. Ruano-Rubio, V. Sanchez, J. F. Saute, F. Shettima, S. da Silva, C. Simpson, V. J. Suddaby, S. Takken, W. Thu, A. M. Toure, M. Unlu, E. Valdivia, H. O. van Vugt, M. Waithira, N. Wellems, T. Wendler, J. White, N. Wuendrich Ogidan, R.
Wellcome Open Res, (2025). 10:325

A pragmatic randomized controlled trial of standard care versus corticosteroids plus standard care for treatment of pneumonia in adults admitted to Kenyan hospitals (SONIA).Lucinde, R. Abdi, A. Orindi, B. Mwakio, S. Gathuri, H. Onyango, E. Chira, S. Ogero, M. Isaaka, L. Shangala, J. Oginga, I. N. Wachira, A. Manuthu, E. Kariuki, H. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. Lusamba, W. Muthui, B. Kirui, N. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Ahmed, N. Gituma, B. Ongaki, V. B. Giabe, M. Omondi, C. Ombajo, L. A. Kagucia, W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, L. I. Kamuya, D. Bejon, P. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
Wellcome Open Res, (2025). 7:269

SEVUparin as a potential Adjunctive Treatment in children with severe malaria: A phase I trial safety and dose finding trial (SEVUSMAART).Maitland, K. Hamaluba, M. Obonyo, N. Oguda, E. Mogoka, C. Williams, T. N. Chaponda, M. Miti, S. Kamavu, L. K. Jonathan Gwasupika, J. Connon, R. Gibb, D. M. Dondorp, A. Day, N. White, N. Walker, A. S. George, E. C. Severe Malaria in African Children, A. Research Trials, consortium
Wellcome Open Res, (2024). 8:484

A Phase I trial of Non-invasive Ventilation and seizure prophylaxis with levetiracetam In Children with Cerebral Malaria Trial (NOVICE-M Trial).Maitland, K. Obonyo, N. Hamaluba, M. Ogoda, E. Mogaka, C. Williams, T. N. Newton, C. Kariuki, S. M. Gibb, D. M. Walker, A. S. Connon, R. George, E. C.
Wellcome Open Res, (2024). 9:281

Mortality among non-severely under nourished children with pneumonia globally: protocol for a systematic review and meta-analysis.Nalwanga, D. Bakker, C. Kiggwe, A. Negash, A. A. Ocan, M. Briend, A. Maitland, K. Musiiime, V. Karamagi, C.
Wellcome Open Res, (2024). 8:551

Therapeutic monitoring of anti-seizure medications in low- and middle-income countries: a systematic review.Odhiambo, M. Kariuki, S. M. Newton, C. R.
Wellcome Open Res, (2024). 6:92

Targeted amplicon deep sequencing of ama1 and mdr1 to track within-host P. falciparum diversity throughout treatment in a clinical drug trial.Wamae, K. Ndwiga, L. Kharabora, O. Kimenyi, K. Osoti, V. de Laurent, Z. Wambua, J. Musyoki, J. Ngetsa, C. Kalume, P. Mwambingu, G. Hamaluba, M. van der Pluijm, R. Dondorp, A. M. Bailey, J. Juliano, J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L.
Wellcome Open Res, (2024). 7:95

Gastroenteritis Rehydration Of children with Severe Acute Malnutrition (GASTROSAM): A Phase II Randomised Controlled trial: Trial Protocol.Olupot-Olupot, P. Aloroker, F. Mpoya, A. Mnjalla, H. Paasi, G. Nakuya, M. Houston, K. Obonyo, N. Hamaluba, M. Evans, J. A. Dewez, M. Atti, S. Guindo, O. Ouattara, S. M. Chara, A. Sainna, H. A. Amos, O. O. Ogundipe, O. Sunyoto, T. Coldiron, M. Langendorf, C. Scherrer, M. F. Petrucci, R. Connon, R. George, E. C. Gibb, D. M. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2024). 6:160

Safety and immunogenicity of varied doses of R21/Matrix-M vaccine at three years follow-up: A phase 1b age de-escalation, dose-escalation trial in adults, children, and infants in Kilifi-Kenya.Sang, S. Datoo, M. S. Otieno, E. Muiruri, C. Bellamy, D. Gathuri, E. Ngoto, O. Musembi, J. Provstgaard-Morys, S. Stockdale, L. Aboagye, J. Woods, D. Lawrie, A. Roberts, R. Keter, K. Kimani, D. Ndungu, F. Kapulu, M. Njau, I. Orindi, B. Ewer, K. J. Hill, A. V. S. Bejon, P. Hamaluba, M.
Wellcome Open Res, (2023). 8:450

Safety and immunogenicity of ChAdOx1 nCoV-19 (AZD1222) vaccine in adults in Kenya: a phase 1/2 single-blind, randomised controlled trial.Hamaluba, M. Sang, S. Orindi, B. Njau, I. Karanja, H. Kamau, N. Gitonga, J. N. Mugo, D. Wright, D. Nyagwange, J. Kutima, B. Omuoyo, D. Mwatasa, M. Ngetsa, C. Agoti, C. Cheruiyot, S. Nyaguara, A. Munene, M. Mturi, N. Oloo, E. Ochola-Oyier, L. Mumba, N. Mauncho, C. Namayi, R. Davies, A. Tsofa, B. Nduati, E. W. Aliyan, N. Kasera, K. Etyang, A. Boyd, A. Hill, A. Gilbert, S. Douglas, A. Pollard, A. Bejon, P. Lambe, T. Warimwe, G. C. O. V. Vaccine Trial Group
Wellcome Open Res, (2023). 8:182

Pharmacokinetics and pharmacodynamics of azithromycin in severe malaria bacterial co-infection in African children (TABS-PKPD): a protocol for a Phase II randomised controlled trial.Olupot-Olupot, P. Okiror, W. Mnjalla, H. Muhindo, R. Uyoga, S. Mpoya, A. Williams, T. N. terHeine, R. Burger, D. M. Urban, B. Connon, R. George, E. C. Gibb, D. M. Walker, A. S. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2023). 6:161

Strategies for improving mental health and wellbeing used by adults ageing with HIV from the Kenyan coast: a qualitative exploration.Mwangala, P. N. Wagner, R. G. Newton, C. R. Abubakar, A.
Wellcome Open Res, (2023). 7:221

Development of a legume-enriched feed for treatment of severe acute malnutrition.Walsh, K. Delamare de la Villenaise de Chenevarin, G. McGurk, J. Maitland, K. Frost, G.
Wellcome Open Res, (2023). 6:206

Pf7: an open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 20,000 worldwide samples.MalariaGen, Abdel Hamid, M. M. Abdelraheem, M. H. Acheampong, D. O. Ahouidi, A. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amaratunga, C. Amenga-Etego, L. Andagalu, B. Anderson, T. Andrianaranjaka, V. Aniebo, I. Aninagyei, E. Ansah, F. Ansah, P. O. Apinjoh, T. Arnaldo, P. Ashley, E. Auburn, S. Awandare, G. A. Ba, H. Baraka, V. Barry, A. Bejon, P. Bertin, G. I. Boni, M. F. Borrmann, S. Bousema, T. Bouyou-Akotet, M. Branch, O. Bull, P. C. Cheah, H. Chindavongsa, K. Chookajorn, T. Chotivanich, K. Claessens, A. Conway, D. J. Corredor, V. Courtier, E. Craig, A. D'Alessandro, U. Dama, S. Day, N. Denis, B. Dhorda, M. Diakite, M. Djimde, A. Dolecek, C. Dondorp, A. Doumbia, S. Drakeley, C. Drury, E. Duffy, P. Echeverry, D. F. Egwang, T. G. Enosse, S. M. M. Erko, B. Fairhurst, R. M. Faiz, A. Fanello, C. A. Fleharty, M. Forbes, M. Fukuda, M. Gamboa, D. Ghansah, A. Golassa, L. Goncalves, S. Harrison, G. L. A. Healy, S. A. Hendry, J. A. Hernandez-Koutoucheva, A. Hien, T. T. Hill, C. A. Hombhanje, F. Hott, A. Htut, Y. Hussein, M. Imwong, M. Ishengoma, D. Jackson, S. A. Jacob, C. G. Jeans, J. Johnson, K. J. Kamaliddin, C. Kamau, E. Keatley, J. Kochakarn, T. Konate, D. S. Konate, A. Kone, A. Kwiatkowski, D. P. Kyaw, M. P. Kyle, D. Lawniczak, M. Lee, S. K. Lemnge, M. Lim, P. Lon, C. Loua, K. M. Mandara, C. I. Marfurt, J. Marsh, K. Maude, R. J. Mayxay, M. Maiga-Ascofare, O. Miotto, O. Mita, T. Mobegi, V. Mohamed, A. O. Mokuolu, O. A. Montgomery, J. Morang'a, C. M. Mueller, I. Murie, K. Newton, P. N. Ngo Duc, T. Nguyen, T. Nguyen, T. N. Nguyen Thi Kim, T. Nguyen Van, H. Noedl, H. Nosten, F. Noviyanti, R. Ntui, V. N. Nzila, A. Ochola-Oyier, L. I. Ocholla, H. Oduro, A. Omedo, I. Onyamboko, M. A. Ouedraogo, J. B. Oyebola, K. Oyibo, W. A. Pearson, R. Peshu, N. Phyo, A. P. Plowe, C. V. Price, R. N. Pukrittayakamee, S. Quang, H. H. Randrianarivelojosia, M. Rayner, J. C. Ringwald, P. Rosanas-Urgell, A. Rovira-Vallbona, E. Ruano-Rubio, V. Ruiz, L. Saunders, D. Shayo, A. Siba, P. Simpson, V. J. Sissoko, M. S. Smith, C. Su, X. Z. Sutherland, C. Takala-Harrison, S. Talman, A. Tavul, L. Thanh, N. V. Thathy, V. Thu, A. M. Toure, M. Tshefu, A. Verra, F. Vinetz, J. Wellems, T. E. Wendler, J. White, N. J. Whitton, G. Yavo, W. van der Pluijm, R. W.
Wellcome Open Res, (2023). 8:22

TRUE-1: Trial of Repurposed Unithiol for snakebite Envenoming phase 1 (safety, tolerability, pharmacokinetics and pharmacodynamics in healthy Kenyan adults).Abouyannis, M. FitzGerald, R. Ngama, M. Mwangudzah, H. Nyambura, Y. K. Ngome, S. Riako, D. Babu, L. Lewa, F. Else, L. Dily Penchala, S. Orindi, B. Mumba, N. Kalama, B. Ndungu, F. M. Adetifa, I. Khoo, S. Lalloo, D. G. Casewell, N. R. Hamaluba, M.
Wellcome Open Res, (2022). 7:90

Barriers to access and utilization of healthcare by children with neurological impairments and disability in low-and middle-income countries: a systematic review.Mwangi, L. W. Abuga, J. A. Cottrell, E. Kariuki, S. M. Kinyanjui, S. M. Newton, C. R.
Wellcome Open Res, (2022). 6:61

Children's Oxygen Administration Strategies And Nutrition Trial (COAST-Nutrition): a protocol for a phase II randomised controlled trial.Kiguli, S. Olopot-Olupot, P. Alaroker, F. Engoru, C. Opoka, R. O. Tagoola, A. Hamaluba, M. Mnjalla, H. Mpoya, A. Mogaka, C. Nalwanga, D. Nabawanuka, E. Nokes, J. Nyaigoti, C. Briend, A. van Woensel, J. B. M. Grieve, R. Sadique, Z. Williams, T. N. Thomas, K. Harrison, D. A. Rowan, K. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2021). 6:221

Validity and reliability of the Neurodevelopmental Screening Tool (NDST) in screening for neurodevelopmental disorders in children living in rural Kenyan coast.Bitta, M. A. Kipkemoi, P. Kariuki, S. M. Abubakar, A. Gona, J. Philips-Owen, J. Newton, C. R.
Wellcome Open Res, (2021). 6:137

An open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 7,000 worldwide samples.MalariaGen, Ahouidi, A. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amaratunga, C. Amato, R. Amenga-Etego, L. Andagalu, B. Anderson, T. J. C. Andrianaranjaka, V. Apinjoh, T. Ariani, C. Ashley, E. A. Auburn, S. Awandare, G. A. Ba, H. Baraka, V. Barry, A. E. Bejon, P. Bertin, G. I. Boni, M. F. Borrmann, S. Bousema, T. Branch, O. Bull, P. C. Busby, G. B. J. Chookajorn, T. Chotivanich, K. Claessens, A. Conway, D. Craig, A. D'Alessandro, U. Dama, S. Day, N. P. Denis, B. Diakite, M. Djimde, A. Dolecek, C. Dondorp, A. M. Drakeley, C. Drury, E. Duffy, P. Echeverry, D. F. Egwang, T. G. Erko, B. Fairhurst, R. M. Faiz, A. Fanello, C. A. Fukuda, M. M. Gamboa, D. Ghansah, A. Golassa, L. Goncalves, S. Hamilton, W. L. Harrison, G. L. A. Hart, L. Henrichs, C. Hien, T. T. Hill, C. A. Hodgson, A. Hubbart, C. Imwong, M. Ishengoma, D. S. Jackson, S. A. Jacob, C. G. Jeffery, B. Jeffreys, A. E. Johnson, K. J. Jyothi, D. Kamaliddin, C. Kamau, E. Kekre, M. Kluczynski, K. Kochakarn, T. Konate, A. Kwiatkowski, D. P. Kyaw, M. P. Lim, P. Lon, C. Loua, K. M. Maiga-Ascofare, O. Malangone, C. Manske, M. Marfurt, J. Marsh, K. Mayxay, M. Miles, A. Miotto, O. Mobegi, V. Mokuolu, O. A. Montgomery, J. Mueller, I. Newton, P. N. Nguyen, T. Nguyen, T. N. Noedl, H. Nosten, F. Noviyanti, R. Nzila, A. Ochola-Oyier, L. I. Ocholla, H. Oduro, A. Omedo, I. Onyamboko, M. A. Ouedraogo, J. B. Oyebola, K. Pearson, R. D. Peshu, N. Phyo, A. P. Plowe, C. V. Price, R. N. Pukrittayakamee, S. Randrianarivelojosia, M. Rayner, J. C. Ringwald, P. Rockett, K. A. Rowlands, K. Ruiz, L. Saunders, D. Shayo, A. Siba, P. Simpson, V. J. Stalker, J. Su, X. Z. Sutherland, C. Takala-Harrison, S. Tavul, L. Thathy, V. Tshefu, A. Verra, F. Vinetz, J. Wellems, T. E. Wendler, J. White, N. J. Wright, I. Yavo, W. Ye, H.
Wellcome Open Res, (2021). 6:42

Mortality during and following hospital admission among school-aged children: a cohort study.Ngari, M. M. Obiero, C. Mwangome, M. K. Nyaguara, A. Mturi, N. Murunga, S. Otiende, M. Iversen, P. O. Fegan, G. W. Walson, J. L. Berkley, J. A.
Wellcome Open Res, (2020). 5:234