edd/Wellcome Open Res

Coxsackievirus A24 variant whole genome sequencing from clinical samples using a three overlapping amplicons strategy.Morobe, J. M. Odoyo, S. Lambisia, A. W. Moraa, E. Houldcroft, C. J. Holmes, E. C. Githinji, G. Agoti, C. N.
Wellcome Open Res, (2025). 10:316

GRAPEVNE - Graphical Analytical Pipeline Development Environment for Infectious Diseases.Brittain, J. S. Tsui, J. Inward, R. Gutierrez, B. Mwanyika, G. Tegally, H. Huynh, T. Githinji, G. Tessema, S. K. McCrone, J. T. Bhatt, S. Dasgupta, A. Ratcliffe, S. Kraemer, M. U. G.
Wellcome Open Res, (2025). 10:279

A pragmatic randomized controlled trial of standard care versus corticosteroids plus standard care for treatment of pneumonia in adults admitted to Kenyan hospitals (SONIA).Lucinde, R. Abdi, A. Orindi, B. Mwakio, S. Gathuri, H. Onyango, E. Chira, S. Ogero, M. Isaaka, L. Shangala, J. Oginga, I. N. Wachira, A. Manuthu, E. Kariuki, H. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. Lusamba, W. Muthui, B. Kirui, N. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Ahmed, N. Gituma, B. Ongaki, V. B. Giabe, M. Omondi, C. Ombajo, L. A. Kagucia, W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, L. I. Kamuya, D. Bejon, P. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
Wellcome Open Res, (2025). 7:269

Identification of coxsackievirus A24 variant during an acute hemorrhagic conjunctivitis outbreak in coastal Kenya, 2024.Lambisia, A. W. Mwita Morobe, J. Moraa, E. Mwarumba, S. Korir, F. K. N. Seif Athman, R. Kiptui, R. Mbee, M. Mugo, N. Amoth, P. Muange, P. J. Houldcroft C Barasa, E. Mwangangi, J. Githinji, G. C. Holmes E Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N.
Wellcome Open Res, (2025). 10:28

Comparative performance of the InBios SCoV-2 Detect (TM) IgG ELISA and the in-house KWTRP ELISA in detecting SARS-CoV-2 spike IgG antibodies in Kenyan populations.Kutima, B. Kagucia, E. W. Mwai, K. Kimani, M. Sigilai, A. Mugo, D. Karanja, H. Gitonga, J. N. Karani, A. Akech, D. Toroitich, M. Karia, B. Tuju, J. Ziraba, A. K. Bigogo, G. Ochieng, C. Onyango, C. Lidechi, S. Munywoki, P. K. Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Oyier, L. I. O. Bejon, P. Scott, J. A. G. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Nyagwange, J. Kenya, Sars-CoV-Serology Consortium
Wellcome Open Res, (2024). 9:349

SEVUparin as a potential Adjunctive Treatment in children with severe malaria: A phase I trial safety and dose finding trial (SEVUSMAART).Maitland, K. Hamaluba, M. Obonyo, N. Oguda, E. Mogoka, C. Williams, T. N. Chaponda, M. Miti, S. Kamavu, L. K. Jonathan Gwasupika, J. Connon, R. Gibb, D. M. Dondorp, A. Day, N. White, N. Walker, A. S. George, E. C. Severe Malaria in African Children, A. Research Trials, consortium
Wellcome Open Res, (2024). 8:484

A Phase I trial of Non-invasive Ventilation and seizure prophylaxis with levetiracetam In Children with Cerebral Malaria Trial (NOVICE-M Trial).Maitland, K. Obonyo, N. Hamaluba, M. Ogoda, E. Mogaka, C. Williams, T. N. Newton, C. Kariuki, S. M. Gibb, D. M. Walker, A. S. Connon, R. George, E. C.
Wellcome Open Res, (2024). 9:281

Gastroenteritis Rehydration Of children with Severe Acute Malnutrition (GASTROSAM): A Phase II Randomised Controlled trial: Trial Protocol.Olupot-Olupot, P. Aloroker, F. Mpoya, A. Mnjalla, H. Paasi, G. Nakuya, M. Houston, K. Obonyo, N. Hamaluba, M. Evans, J. A. Dewez, M. Atti, S. Guindo, O. Ouattara, S. M. Chara, A. Sainna, H. A. Amos, O. O. Ogundipe, O. Sunyoto, T. Coldiron, M. Langendorf, C. Scherrer, M. F. Petrucci, R. Connon, R. George, E. C. Gibb, D. M. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2024). 6:160

Safety and immunogenicity of ChAdOx1 nCoV-19 (AZD1222) vaccine in adults in Kenya: a phase 1/2 single-blind, randomised controlled trial.Hamaluba, M. Sang, S. Orindi, B. Njau, I. Karanja, H. Kamau, N. Gitonga, J. N. Mugo, D. Wright, D. Nyagwange, J. Kutima, B. Omuoyo, D. Mwatasa, M. Ngetsa, C. Agoti, C. Cheruiyot, S. Nyaguara, A. Munene, M. Mturi, N. Oloo, E. Ochola-Oyier, L. Mumba, N. Mauncho, C. Namayi, R. Davies, A. Tsofa, B. Nduati, E. W. Aliyan, N. Kasera, K. Etyang, A. Boyd, A. Hill, A. Gilbert, S. Douglas, A. Pollard, A. Bejon, P. Lambe, T. Warimwe, G. C. O. V. Vaccine Trial Group
Wellcome Open Res, (2023). 8:182

Pharmacokinetics and pharmacodynamics of azithromycin in severe malaria bacterial co-infection in African children (TABS-PKPD): a protocol for a Phase II randomised controlled trial.Olupot-Olupot, P. Okiror, W. Mnjalla, H. Muhindo, R. Uyoga, S. Mpoya, A. Williams, T. N. terHeine, R. Burger, D. M. Urban, B. Connon, R. George, E. C. Gibb, D. M. Walker, A. S. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2023). 6:161

Assessment of gestational age at antenatal care visits among Kenyan women to inform delivery of a maternal respiratory syncytial virus (RSV) vaccine in low- and middle-income countries.Nyiro, J. U. Nyawanda, B. O. Bukusi, E. Mureithi, M. W. Murunga, N. Nokes, D. J. Bigogo, G. Otieno, N. A. Opere, V. A. Ouma, A. Pecenka, C. Munywoki, P. K.
Wellcome Open Res, (2023). 8:154

Revealing the extent of the first wave of the COVID-19 pandemic in Kenya based on serological and PCR-test data.Ojal, J. Brand, S. P. C. Were, V. Okiro, E. A. Kombe, I. K. Mburu, C. Aziza, R. Ogero, M. Agweyu, A. Warimwe, G. M. Uyoga, S. Adetifa, I. M. O. Scott, J. A. G. Otieno, E. Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N. Kasera, K. Amoth, P. Mwangangi, M. Aman, R. Ng'ang'a, W. Tsofa, B. Bejon, P. Barasa, E. Keeling, M. J. Nokes, D. J.
Wellcome Open Res, (2022). 6:127

Epidemiology of COVID-19 infections on routine polymerase chain reaction (PCR) and serology testing in Coastal Kenya.Nyagwange, J. Ndwiga, L. Muteru, K. Wamae, K. Tuju, J. Testing Team, C. Kutima, B. Gitonga, J. Karanja, H. Mugo, D. Kasera, K. Amoth, P. Murunga, N. Babu, L. Otieno, E. Githinji, G. Nokes, D. J. Tsofa, B. Orindi, B. Barasa, E. Warimwe, G. Agoti, C. N. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
Wellcome Open Res, (2022). 7:69

Efficiency of transplacental transfer of respiratory syncytial virus (RSV) specific antibodies among pregnant women in Kenya.Nyiro, J. U. Bukusi, E. Mwaengo, D. Nyaguara, A. Nyawanda, B. Otieno, N. Bigogo, G. Murunga, N. Widdowson, M. A. Verani, J. R. Chaves, S. S. Mwangudza, H. Odundo, C. Berkley, J. A. Nokes, D. J. Munywoki, P. K.
Wellcome Open Res, (2022). 7:43

TRUE-1: Trial of Repurposed Unithiol for snakebite Envenoming phase 1 (safety, tolerability, pharmacokinetics and pharmacodynamics in healthy Kenyan adults).Abouyannis, M. FitzGerald, R. Ngama, M. Mwangudzah, H. Nyambura, Y. K. Ngome, S. Riako, D. Babu, L. Lewa, F. Else, L. Dily Penchala, S. Orindi, B. Mumba, N. Kalama, B. Ndungu, F. M. Adetifa, I. Khoo, S. Lalloo, D. G. Casewell, N. R. Hamaluba, M.
Wellcome Open Res, (2022). 7:90

Mortality in rural coastal Kenya measured using the Kilifi Health and Demographic Surveillance System: a 16-year descriptive analysis.Otiende, M. Bauni, E. Nyaguara, A. Amadi, D. Nyundo, C. Tsory, E. Walumbe, D. Kinuthia, M. Kihuha, N. Kahindi, M. Nyutu, G. Moisi, J. Deribew, A. Agweyu, A. Marsh, K. Tsofa, B. Bejon, P. Bottomley, C. Williams, T. N. Scott, J. A. G.
Wellcome Open Res, (2021). 6:327

Children's Oxygen Administration Strategies And Nutrition Trial (COAST-Nutrition): a protocol for a phase II randomised controlled trial.Kiguli, S. Olopot-Olupot, P. Alaroker, F. Engoru, C. Opoka, R. O. Tagoola, A. Hamaluba, M. Mnjalla, H. Mpoya, A. Mogaka, C. Nalwanga, D. Nabawanuka, E. Nokes, J. Nyaigoti, C. Briend, A. van Woensel, J. B. M. Grieve, R. Sadique, Z. Williams, T. N. Thomas, K. Harrison, D. A. Rowan, K. Maitland, K.
Wellcome Open Res, (2021). 6:221

Whole genome sequencing of two human rhinovirus A types (A101 and A15) detected in Kenya, 2016-2018.Luka, M. M. Kamau, E. de Laurent, Z. R. Morobe, J. M. Alii, L. K. Nokes, D. J. Agoti, C. N.
Wellcome Open Res, (2021). 6:178

Haplotype heterogeneity and low linkage disequilibrium reduce reliable prediction of genotypes for the ÔÇæalpha (3.7I) form of alpha-thalassaemia using genome-wide microarray data.Ndila, C. M. Nyirongo, V. Macharia, A. W. Jeffreys, A. E. Rowlands, K. Hubbart, C. Busby, G. B. J. Band, G. Harding, R. M. Rockett, K. A. Williams, T. N. Malaria, G. E. N. Consortium
Wellcome Open Res, (2020). 5:287

Mortality during and following hospital admission among school-aged children: a cohort study.Ngari, M. M. Obiero, C. Mwangome, M. K. Nyaguara, A. Mturi, N. Murunga, S. Otiende, M. Iversen, P. O. Fegan, G. W. Walson, J. L. Berkley, J. A.
Wellcome Open Res, (2020). 5:234