Isabella Ochola-Oyier

Longitudinal Epidemiology and Variant Dynamics of SARS-CoV-2 in Coastal Kenya (2020-2025): Clinical Features and Wave Patterns.Lambisia, A. W. Nyiro, J. Githinji, G. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Mutunga, M. Maina, G. Bejon, P. Phan, M. V. T. Cotten, M. Dellicour, S. Ochola-Oyier, L. I. Sande, C. Holmes, E. C. Nyagwange, J. Agoti, C. N.
Open Forum Infect Dis, (2026). 13:ofag084

Evolving patterns of antimalarial drug resistance markers in symptomatic infections in Kenya, 2013-2022.Magudha, J. Ndwiga, L. Akinyi, M. Y. Wamae, K. Osoti, V. Kandie, R. Kiplagat, R. Keitany, K. Bargul, J. L. Akala, H. M. Ochola-Oyier, L. I.
Parasit Vectors, (2026). 19:

Pre-COVID-19 ex vivo cross-reactive IFN-gamma cellular response to SARS-CoV-2 spike overlapping peptides is more prevalent among Kenyan compared to Swedish adults.Wanjiku, P. Orindi, B. Mwacharo, J. Chemweno, J. Karanja, H. K. Kronsteiner, B. Kai, O. Wright, D. Ochola-Oyier, L. I. Sundling, C. Dunachie, S. Warimwe, G. M. Farnert, A. Bejon, P. Ndungu, F. M. Nduati, E. W.
BMC Infect Dis, (2026). 26:174

Malaria vaccine protection against intradermal or venous parasites: a randomized phase 2b human challenge trial.Kapulu, M. C. Orenge, F. Kimani, D. Kibwana, E. Kibet, H. Mutahi, M. Datoo, M. S. Bellamy, D. Musembi, J. Ngoto, O. Rashid, H. Akinyi, S. Mwatasa, M. H. Nyamako, L. Keter, K. Gatheru, R. Mutiso, A. Musyoki, J. Mwacharo, J. Abebe, Y. James, E. R. Billingsley, P. F. Ngetsa, C. Mosobo, M. Makale, J. Tawa, B. Wamae, K. Ochola-Oyier, L. I. Lawrie, A. Ramos-Lopez, F. Roberts, R. Richie, T. L. Sim, B. K. L. Hoffman, S. L. Ewer, K. J. Hill, A. V. S. Hamaluba, M. Bejon, P.
Nat Med, (2026). 32:178-185

Characterizing Plasmodium falciparum genetic diversity and complexity of infections in clinical malaria infections in Western and Coastal Kenya using the poly-alpha microsatellite marker.Abade, N. A. Mgawe, C. Ndwiga, L. Kimenyi, K. M. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2025). 24:452

Pf8: an open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 33,325 worldwide samples.Malaria Genomic Epidemiology, Network Abdel Hamid, M. M. Abdelraheem, M. H. Acheampong, D. O. Adam, I. Aide, P. Ajibaye, O. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amenga-Etego, L. Aniebo, I. Aninagyei, E. Ansah, F. Apinjoh, T. O. Ariani, C. V. Auburn, S. Awandare, G. A. Balmer, A. Bejon, P. Boene, S. Bwire, G. Candrinho, B. Chidimatembue, A. Chindavongsa, K. Comiche, K. Conway, D. Dara, A. Diakite, M. Djimde, A. Dondorp, A. Doumbia, S. Drury, E. Fanello, C. A. Ferdig, M. Figueroa, K. Gamboa, D. Golassa, L. Goncalves, S. Guindo, M. D. A. Hamaluba, M. Hanboonkunupakarn, B. Howe, K. Hussien, M. Imwong, M. Ishengoma, D. Jeans, J. Kabaghe, A. Kamuhabwa, A. Kindermans, J. M. Konate, D. S. Kwiatkowski, D. P. Lee, C. Lee, S. K. Lee, S. J. Ley, B. Llanos-Cuentas, A. Marfurt, J. Matambisso, G. Maude, R. R. Maude, R. J. Mayor, A. Mayxay, M. Maiga-Ascofare, O. McCann, R. S. Miles, A. Miotto, O. Mohamed, A. O. Morang'a, C. M. Murie, K. Ngasala, B. E. Nguyen, T. N. Nolasco, O. Nosten, F. Noviyanti, R. O'Connor, I. Oboh, M. Ochola-Oyier, L. I. Olufunke Falade, C. Olukosi, A. Olumide, A. Olusola, F. I. Onyamboko, M. A. Oriero, E. C. Oyibo, W. A. Pannebaker, D. Pearson, R. D. Phiri, K. van der Pluijm, R. W. Price, R. N. Quang, H. H. Rajkumar Devaraju, V. Randrianarivelojosia, M. Ranford-Cartwright, L. Rayner, J. C. Rovira-Vallbona, E. Rowlands, K. Ruano-Rubio, V. Sanchez, J. F. Saute, F. Shettima, S. da Silva, C. Simpson, V. J. Suddaby, S. Takken, W. Thu, A. M. Toure, M. Unlu, E. Valdivia, H. O. van Vugt, M. Waithira, N. Wellems, T. Wendler, J. White, N. Wuendrich Ogidan, R.
Wellcome Open Res, (2025). 10:325

A scoping review of antimalarial drug resistance markers in Kenya (1987-2022): toward a National Surveillance Framework and Data Repository.Wamae, K. Magudha, J. Asiimwe, E. Kimani, K. Kandie, R. Keitany, K. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2025). 24:413

Serial cross-sectional school surveys identifies C469Y, P553L, R561H and A675V kelch 13 mutations associated with artemisinin resistance in Western Kenya.Osoti, V. Wamae, K. Musau, M. M. Magudha, J. B. Ndwiga, L. Gichuki, P. M. Okoyo, C. Rosebella, K. Mahugu, S. Aricha, S. Kandie, R. Keitany, K. Kepha, S. Mwandawiro, C. Bejon, P. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
Sci Rep, (2025). 15:38303

Assessing the Impact of SARS-CoV-2 Spike Mutations on Antibody Binding: A Comparative Assessment of the Wuhan and JN.1 Variants' Full-Length Spikes in a Multiplex Luminex Assay.Waweru, G. Nyakundi, R. Kutima, B. Owuor, S. Konyino, G. Gitonga, J. Lugano, D. Maina, A. Musyoki, J. Ochola, L. Omondi, M. Kariuki, C. K. Ogongo, P. Mwachari, C. Shee, F. Agoti, C. Sande, C. Uyoga, S. Kagucia, E. Agweyu, A. Bejon, P. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
Viruses, (2025). 17:

Induction of an early IFN-gamma cellular response and high plasma levels of SDF-1alpha are inversely associated with COVID-19 severity and residence in rural areas in Kenyan patients.Wanjiku, P. Orindi, B. Kimotho, J. Sayed, S. Shah, R. Saleh, M. Mwacharo, J. Maronga, C. Olouch, V. Karanu, A. Shah, J. Nneka, Z. Ochola-Oyier, L. I. Abdi, A. I. Dunachie, S. Bejon, P. Nduati, E. W. Ndungu, F. M.
PLoS One, (2025). 20:e0316967

Genomic and clinical epidemiology of SARS-CoV-2 in coastal Kenya: insights into variant circulation, reinfection, and multiple lineage importations during a post-pandemic wave.Lambisia, A. W. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Gallagher, K. Mutunga, M. Nyale, E. Omungala, J. Mwanga, M. Murunga, N. Nyiro, J. Nyagwange, J. Sande, C. Bejon, P. Githinji, G. Dellicour, S. Phan, M. V. T. Cotten, M. Ochola-Oyier, L. I. Holmes, E. C. Agoti, C. N.
BMC Glob Public Health, (2025). 3:80

Emergence and transmission dynamics of the FY.4 Omicron variant in Kenya.Musundi, S. Mwanga, M. Lambisia, A. Morobe, J. M. Murunga, N. Moraa, E. Ndwiga, L. Cheruiyot, R. Musyoki, J. Mutunga, M. Guzman-Rincon, L. M. Sande, C. Mwangangi, J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N. Nyiro, J. Githinji, G.
Virus Evol, (2025). 11:veaf035

A pragmatic randomized controlled trial of standard care versus corticosteroids plus standard care for treatment of pneumonia in adults admitted to Kenyan hospitals (SONIA).Lucinde, R. Abdi, A. Orindi, B. Mwakio, S. Gathuri, H. Onyango, E. Chira, S. Ogero, M. Isaaka, L. Shangala, J. Oginga, I. N. Wachira, A. Manuthu, E. Kariuki, H. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. Lusamba, W. Muthui, B. Kirui, N. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Ahmed, N. Gituma, B. Ongaki, V. B. Giabe, M. Omondi, C. Ombajo, L. A. Kagucia, W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, L. I. Kamuya, D. Bejon, P. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
Wellcome Open Res, (2025). 7:269

The genome sequence of varicella-zoster virus (Varicellovirus humanalpha3) obtained by metagenomics from a patient presenting with an exanthem rash.Musundi, S. Okanda, D. Lambisia, A. Morobe, J. M. Muthanje, E. Ochola-Oyier, L. I. Carter, D. P. Agoti, C. N. Kiiru, J. Githinji, G.
Microbiol Resour Announc, (2025). 14:e0024825

Stable Plasmodium falciparum merozoite surface protein-1 allelic diversity despite decreasing parasitaemia in children with multiple malaria infections.Yaa, R. M. Kimenyi, K. M. Palasciano, H. A. Obiero, G. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2025). 24:136

Identification of coxsackievirus A24 variant during an acute hemorrhagic conjunctivitis outbreak in coastal Kenya, 2024.Lambisia, A. W. Mwita Morobe, J. Moraa, E. Mwarumba, S. Korir, F. K. N. Seif Athman, R. Kiptui, R. Mbee, M. Mugo, N. Amoth, P. Muange, P. J. Houldcroft C Barasa, E. Mwangangi, J. Githinji, G. C. Holmes E Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N.
Wellcome Open Res, (2025). 10:28

Rethinking the evidence on COVID-19 in Africa.Bejon, P. Agweyu, A. Ochola-Oyier, L. I. Hamaluba, M. Kamuya, D. Kinyanjui, S. Barasa, E.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:e463-e471

Detection of low frequency artemisinin resistance mutations, C469Y, P553L and A675V, and fixed antifolate resistance mutations in asymptomatic primary school children in Kenya.Osoti, V. Wamae, K. Ndwiga, L. Gichuki, P. M. Okoyo, C. Kepha, S. Keitany, K. Kandie, R. Aricha, S. Kiplagat, R. Mwandawiro, C. Bejon, P. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
BMC Infect Dis, (2025). 25:73

Regional action needed to halt antimalarial drug resistance in Africa.Martinez-Vega, R. Ishengoma, D. S. Gosling, R. Rosenthal, P. J. Dondorp, A. Barnes, K. I. Nsanzabana, C. Djimde, A. A. Ochola-Oyier, L. I. Tibenderana, J. Chimumbwa, J. Golassa, L. Kapologwe, N. A. Mbacham, W. F. Kamya, M. R. Fidock, D. A. Komatsu, R. von Seidlein, L. Dhorda, M.
Lancet, (2025). 405:7-10

Kinetics of naturally induced binding and neutralising anti-SARS-CoV-2 antibody levels and potencies among SARS-CoV-2 infected Kenyans with diverse grades of COVID-19 severity: an observational study.Kimotho, J. Sein, Y. Sayed, S. Shah, R. Mwai, K. Saleh, M. Wanjiku, P. Mwacharo, J. Nyagwange, J. Karanja, H. Kutima, B. Gitonga, J. N. Mugo, D. Karanu, A. Moranga, L. Oluoch, V. Shah, J. Mutiso, J. Mburu, A. Nneka, Z. Betti, P. Usyu Mutinda, W. Abdi, A. I. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Warimwe, G. M. Nduati, E. W. Ndungu, F. M.
Wellcome Open Res, (2025). 8:350