Philip Bejon

African-specific genetic loci determine iron status and risk of severe malaria and bacteremia in African children.Muriuki, J. M. Mentzer, A. J. Band, G. Chong, A. Y. Macharia, A. W. Mogire, R. M. Abuga, K. M. Mitchell, R. Gilchrist, J. J. Webb, E. L. Ndungu, F. M. Raffield, L. M. Ekunwe, L. Bentley, A. R. Sirima, S. B. Madhi, S. A. Hill, A. V. S. Prentice, A. M. Bejon, P. Hemani, G. Smith, G. D. Sandhu, M. S. Elliott, A. M. Williams, T. N. Adeyemo, A. Atkinson, S. H.
Nat Commun, (2026). :

Longitudinal Epidemiology and Variant Dynamics of SARS-CoV-2 in Coastal Kenya (2020-2025): Clinical Features and Wave Patterns.Lambisia, A. W. Nyiro, J. Githinji, G. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Mutunga, M. Maina, G. Bejon, P. Phan, M. V. T. Cotten, M. Dellicour, S. Ochola-Oyier, L. I. Sande, C. Holmes, E. C. Nyagwange, J. Agoti, C. N.
Open Forum Infect Dis, (2026). 13:ofag084

B and T cell responses to pre-erythrocytic R21/Matrix-M and blood-stage RH5.1/Matrix-M malaria vaccines in endemic settings.Bundi, C. K. Munoz, O. Kibwana, E. Bellamy, D. Stockdale, L. Barrett, J. R. McHugh, K. Mtaka, I. Kalinga, W. Kimani, D. Nyamako, L. Keter, K. Ogwang, R. Hill, A. V. S. Bejon, P. Hamaluba, M. Silk, S. E. Minassian, A. M. Draper, S. J. Olotu, A. I. Kapulu, M. C. Ewer, K. J. Nielsen, C. M.
Front Immunol, (2026). 17:1743327

Prevalence, spatial and temporal distribution of tungiasis in the Kilifi Health and Demographic Surveillance System (KHDSS) in Kenya.Ouma, N. Muchiri, S. K. Nyundo, C. Walumbe, D. Nyaguara, A. Maia, M. Adetifa, I. Orindi, B. Bejon, P. Fillinger, U. Elson, L.
BMJ Glob Health, (2026). 11:

Variation in antiviral immunity and inflammation pathways precedes HIV-1 infection in a high-risk African cohort.Kioko, M. Mwangi, S. Fwambah, L. Hassan, A. S. Blackard, J. T. Bejon, P. Sanders, E. Ndung'u, T. Nduati, E. W. Abdi, A. I.
J Clin Invest, (2026). 136:

Pre-COVID-19 ex vivo cross-reactive IFN-gamma cellular response to SARS-CoV-2 spike overlapping peptides is more prevalent among Kenyan compared to Swedish adults.Wanjiku, P. Orindi, B. Mwacharo, J. Chemweno, J. Karanja, H. K. Kronsteiner, B. Kai, O. Wright, D. Ochola-Oyier, L. I. Sundling, C. Dunachie, S. Warimwe, G. M. Farnert, A. Bejon, P. Ndungu, F. M. Nduati, E. W.
BMC Infect Dis, (2026). 26:174

Low-dose yellow fever vaccination in infants: a randomised, double-blind, non-inferiority trial.Kimathi, D. Juan-Giner, A. Bob, N. S. Orindi, B. Namulwana, M. L. Diatta, A. Cheruiyot, S. Fall, G. Dia, M. Hamaluba, M. M. Nyehangane, D. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Omuoyo, D. O. Hussein, M. Oloo, E. Kamau, N. Wafula, J. Bendera, J. Silvester, N. Mwavita, J. Joshua, M. Thuranira, J. M. Agababyona, C. Ngetsa, C. Aisha, N. Moki, F. Buluku, T. Munene, M. Mwanga-Amumpaire, J. Lutwama, J. Kayiwa, J. Kamaara, E. Barrett, A. D. Kaleebu, P. Bejon, P. Sall, A. A. Grais, R. F. Warimwe, G. M.
Lancet, (2026). 407:497-504

Malaria vaccine protection against intradermal or venous parasites: a randomized phase 2b human challenge trial.Kapulu, M. C. Orenge, F. Kimani, D. Kibwana, E. Kibet, H. Mutahi, M. Datoo, M. S. Bellamy, D. Musembi, J. Ngoto, O. Rashid, H. Akinyi, S. Mwatasa, M. H. Nyamako, L. Keter, K. Gatheru, R. Mutiso, A. Musyoki, J. Mwacharo, J. Abebe, Y. James, E. R. Billingsley, P. F. Ngetsa, C. Mosobo, M. Makale, J. Tawa, B. Wamae, K. Ochola-Oyier, L. I. Lawrie, A. Ramos-Lopez, F. Roberts, R. Richie, T. L. Sim, B. K. L. Hoffman, S. L. Ewer, K. J. Hill, A. V. S. Hamaluba, M. Bejon, P.
Nat Med, (2026). 32:178-185

Pf8: an open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 33,325 worldwide samples.Malaria Genomic Epidemiology, Network Abdel Hamid, M. M. Abdelraheem, M. H. Acheampong, D. O. Adam, I. Aide, P. Ajibaye, O. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amenga-Etego, L. Aniebo, I. Aninagyei, E. Ansah, F. Apinjoh, T. O. Ariani, C. V. Auburn, S. Awandare, G. A. Balmer, A. Bejon, P. Boene, S. Bwire, G. Candrinho, B. Chidimatembue, A. Chindavongsa, K. Comiche, K. Conway, D. Dara, A. Diakite, M. Djimde, A. Dondorp, A. Doumbia, S. Drury, E. Fanello, C. A. Ferdig, M. Figueroa, K. Gamboa, D. Golassa, L. Goncalves, S. Guindo, M. D. A. Hamaluba, M. Hanboonkunupakarn, B. Howe, K. Hussien, M. Imwong, M. Ishengoma, D. Jeans, J. Kabaghe, A. Kamuhabwa, A. Kindermans, J. M. Konate, D. S. Kwiatkowski, D. P. Lee, C. Lee, S. K. Lee, S. J. Ley, B. Llanos-Cuentas, A. Marfurt, J. Matambisso, G. Maude, R. R. Maude, R. J. Mayor, A. Mayxay, M. Maiga-Ascofare, O. McCann, R. S. Miles, A. Miotto, O. Mohamed, A. O. Morang'a, C. M. Murie, K. Ngasala, B. E. Nguyen, T. N. Nolasco, O. Nosten, F. Noviyanti, R. O'Connor, I. Oboh, M. Ochola-Oyier, L. I. Olufunke Falade, C. Olukosi, A. Olumide, A. Olusola, F. I. Onyamboko, M. A. Oriero, E. C. Oyibo, W. A. Pannebaker, D. Pearson, R. D. Phiri, K. van der Pluijm, R. W. Price, R. N. Quang, H. H. Rajkumar Devaraju, V. Randrianarivelojosia, M. Ranford-Cartwright, L. Rayner, J. C. Rovira-Vallbona, E. Rowlands, K. Ruano-Rubio, V. Sanchez, J. F. Saute, F. Shettima, S. da Silva, C. Simpson, V. J. Suddaby, S. Takken, W. Thu, A. M. Toure, M. Unlu, E. Valdivia, H. O. van Vugt, M. Waithira, N. Wellems, T. Wendler, J. White, N. Wuendrich Ogidan, R.
Wellcome Open Res, (2025). 10:325

Serial cross-sectional school surveys identifies C469Y, P553L, R561H and A675V kelch 13 mutations associated with artemisinin resistance in Western Kenya.Osoti, V. Wamae, K. Musau, M. M. Magudha, J. B. Ndwiga, L. Gichuki, P. M. Okoyo, C. Rosebella, K. Mahugu, S. Aricha, S. Kandie, R. Keitany, K. Kepha, S. Mwandawiro, C. Bejon, P. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
Sci Rep, (2025). 15:38303

MALDI-TOF MS for malaria vector surveillance: A cost-comparison analysis using a decision-tree approach.Karisa, J. Rist, C. Tuwei, M. Ominde, K. Bartilol, B. Ondieki, Z. Musani, H. Wanjiku, C. Mwangangi, J. Mbogo, C. Rono, M. Bejon, P. Maia, M.
PLoS One, (2025). 20:e0335764

A Pragmatic Trial of Glucocorticoids for Community-Acquired Pneumonia.Lucinde, R. K. Gathuri, H. Mwaniki, P. Orindi, B. Otieno, E. O. Mwakio, S. Mulemi, L. Isaaka, L. Shangala, J. Saisi, M. Isinde, E. Oginga, I. N. Wachira, A. W. Manuthu, E. Kariuki, H. Asaava, P. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. M. Lusamba, W. Muthui, B. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Aliyan, N. A. Gituma, B. Matiko, M. G. Omondi, C. A. Ombajo, L. A. Kirui, N. Ochola, L. Abdi, A. I. Kagucia, E. W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, I. Kamuya, D. Bejon, P. Barasa, E. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
N Engl J Med, (2025). 393:2187-2197

Controlled human malaria infection studies: insights into recent advances and key immunological and ethical implementation lessons.Ogwang, R. Adan, M. Bejon, P. Kapulu, M. C.
Front Immunol, (2025). 16:1672945

Assessing the Impact of SARS-CoV-2 Spike Mutations on Antibody Binding: A Comparative Assessment of the Wuhan and JN.1 Variants' Full-Length Spikes in a Multiplex Luminex Assay.Waweru, G. Nyakundi, R. Kutima, B. Owuor, S. Konyino, G. Gitonga, J. Lugano, D. Maina, A. Musyoki, J. Ochola, L. Omondi, M. Kariuki, C. K. Ogongo, P. Mwachari, C. Shee, F. Agoti, C. Sande, C. Uyoga, S. Kagucia, E. Agweyu, A. Bejon, P. Scott, J. A. G. Warimwe, G. M. Ochola-Oyier, L. I. Nyagwange, J.
Viruses, (2025). 17:

Induction of an early IFN-gamma cellular response and high plasma levels of SDF-1alpha are inversely associated with COVID-19 severity and residence in rural areas in Kenyan patients.Wanjiku, P. Orindi, B. Kimotho, J. Sayed, S. Shah, R. Saleh, M. Mwacharo, J. Maronga, C. Olouch, V. Karanu, A. Shah, J. Nneka, Z. Ochola-Oyier, L. I. Abdi, A. I. Dunachie, S. Bejon, P. Nduati, E. W. Ndungu, F. M.
PLoS One, (2025). 20:e0316967

Genomic and clinical epidemiology of SARS-CoV-2 in coastal Kenya: insights into variant circulation, reinfection, and multiple lineage importations during a post-pandemic wave.Lambisia, A. W. Katama, E. N. Moraa, E. Mwita, J. M. Gallagher, K. Mutunga, M. Nyale, E. Omungala, J. Mwanga, M. Murunga, N. Nyiro, J. Nyagwange, J. Sande, C. Bejon, P. Githinji, G. Dellicour, S. Phan, M. V. T. Cotten, M. Ochola-Oyier, L. I. Holmes, E. C. Agoti, C. N.
BMC Glob Public Health, (2025). 3:80

Making MALDI-TOF MS for entomological parameters accessible: A practical guide for in-house library creation.Karisa, J. Tuwei, M. Ominde, K. Bartilol, B. Ondieki, Z. Musani, H. Rono, M. Mbogo, C. Bejon, P. Mwangangi, J. Wanjiku, C. Maia, M.
PLoS One, (2025). 20:e0330605

R21/Matrix-M malaria vaccine drives diverse immune responses in pre-exposed adults: insights from a phase IIb controlled human malaria infection trial.Kibwana, E. Bundi, C. Kimani, D. Nyamako, L. Keter, K. Mutiso, A. Ogwang, R. Bellamy, D. Rapi, K. Bajer, A. Provstgaard-Morys, S. Stockdale, L. Munoz, O. Datoo, M. S. Lawrie, A. Ramos-Lopez, F. Roberts, R. Hamaluba, M. Hill, A. V. S. Bejon, P. Ewer, K. J. Kapulu, M.
Front Immunol, (2025). 16:1620365

Vaccine-induced responses to R21/Matrix-M - an analysis of samples from a phase 1b age de-escalation, dose-escalation trial.Bundi, C. Bellamy, D. Kibwana, E. Nyamako, L. Ogwang, R. Keter, K. Kimani, D. Salman, A. M. Provstgaard-Morys, S. Stockdale, L. Hill, A. V. S. Bejon, P. Olotu, A. Hamaluba, M. Ewer, K. J. Kapulu, M. C.
Front Immunol, (2025). 16:1620366

Emergence and transmission dynamics of the FY.4 Omicron variant in Kenya.Musundi, S. Mwanga, M. Lambisia, A. Morobe, J. M. Murunga, N. Moraa, E. Ndwiga, L. Cheruiyot, R. Musyoki, J. Mutunga, M. Guzman-Rincon, L. M. Sande, C. Mwangangi, J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N. Nyiro, J. Githinji, G.
Virus Evol, (2025). 11:veaf035