Publications

Biosciences

The genome sequence of varicella-zoster virus (Varicellovirus humanalpha3) obtained by metagenomics from a patient presenting with an exanthem rash.Musundi, S. Okanda, D. Lambisia, A. Morobe, J. M. Muthanje, E. Ochola-Oyier, L. I. Carter, D. P. Agoti, C. N. Kiiru, J. Githinji, G.
Microbiol Resour Announc, (2025). 14:e0024825

OSBPL11 is an African-specific locus associated with 25-hydroxyvitamin D concentrations and cardiometabolic health.Mogire, R. M. Muriuki, J. M. Bayimenye, R. F. Mentzer, A. J. Chong, A. Gouveia, M. H. Bentley, A. R. Band, G. King'ori, P. Mitchell, R. Webb, E. L. Sengupta, D. Ekunwe, L. Ndungu, F. M. Morovat, A. Macharia, A. W. Cutland, C. L. Hemani, G. Sirima, S. B. Ramsay, M. Figueiredo, C. A. Prentice, A. M. Madhi, S. A. Raffield, L. M. Sandhu, M. S. Bejon, P. Smith, G. D. Elliott, A. M. Williams, T. N. Rotimi, C. Bourne, C. R. Burgett, A. Adeyemo, A. Atkinson, S. H.
medRxiv, (2025). :

COVID-19 mortality in Africa and Asia - Authors' reply.Bejon, P. Agweyu, A. Oyier, I. Hamaluba, M. Kamuya, D. Kinyanjui, S. Barasa, E.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:e440

Safety and broad immunogenicity of HIVconsvX conserved mosaic candidate T-cell vaccines vectored by ChAdOx1 and MVA in HIV-CORE 006: a double-blind, randomised, placebo-controlled phase 1 trial in healthy adults living without HIV-1 in eastern and southern Africa.Chanda, C. Kibengo, F. Mutua, M. Ogada, F. Muturi-Kioi, V. Akis Yildirim, B. M. Amondi, M. Baines, A. Basajja, V. Borthwick, N. Bosire, K. Chambula, E. Chetty, P. Chinyenze, K. Chirro, O. Crook, A. De Bont, J. Fernandez, N. Ejou, P. Farah, B. Glaze, M. Gombe, B. Gumbe, A. Hayes, P. Itwi, S. Juma, S. Kabarambi, A. Kabengele, C. Kafeero, P. Kakande, A. Kanungi, J. Kidega, W. King, D. Mahira, R. Malogo, R. Matsoso, M. Michelo, C. Moyo, A. Mugaba, S. Mugenya, I. Muhumuza, P. Mujadidi, Y. F. Muriuki, M. Musale, V. Mutua, G. Muwowo, M. Mwale, F. Mwangi, I. Nakimbugwe, M. Namuyanja, A. Nduati, E. Nielsen, L. Nyange, J. Oino, G. Okech, B. Omosa-Manyonyi, G. Otieno, D. Palmer, S. Phiri, H. Ramko, K. Rutishauser, R. L. Sayeed, E. Sajabi, R. Serwanga, J. G. T. Wee E Wenden, C. Cicconi, P. Fast, P. Gilmour, J. Jaoko, W. Kaleebu, P. Kilembe, W. Kuipers, H. Sanders, E. J. Hanke, T.
Lancet Microbe, (2025). 6:101041

Genetic diversity and natural selection of Plasmodium falciparum Pf41 vaccine candidate in clinical isolates from Senegal.Sane, R. Sambe, B. S. Diagne, A. Faye, J. Sarr, F. D. Diaw, S. O. M. Sarr, I. Diatta, A. S. Diatta, H. A. M. Sembene, P. M. Vigan-Womas, I. Toure-Balde, A. Osier, F. Niang, M.
Sci Rep, (2025). 15:16516

Reversible host cell surface remodelling limits immune recognition and maximizes survival of Plasmodium falciparum gametocytes.Ngotho, P. Dantzler Press, K. Peedell, M. Muasya, W. Omondi, B. R. Otoboh, S. E. Gomez, J. Coronado, L. Seydel, K. B. Kapulu, M. Laufer, M. Taylor, T. Bousema, T. Marti, M.
PLoS Pathog, (2025). 21:e1013110

Age structure and parity status determination of Afrotropical malaria vectors using MALDI-TOF MS.Tuwei, M. Karisa, J. Kiuru, C. Ondieki, Z. Odongo, T. Muturi, M. Mure, F. Otieno, B. Okoko, M. Bartilol, B. Gona, R. Ominde, K. Constantino, L. Cole, G. Anastacio, T. Candrinho, B. Armazia, R. Alves, C. Ramaita, E. Rono, M. Mwangangi, J. Mbogo, C. Saute, F. Chaccour, C. Wanjiku, C. Maia, M.
Sci Rep, (2025). 15:15848

Stable Plasmodium falciparum merozoite surface protein-1 allelic diversity despite decreasing parasitaemia in children with multiple malaria infections.Yaa, R. M. Kimenyi, K. M. Palasciano, H. A. Obiero, G. Ochola-Oyier, L. I.
Malar J, (2025). 24:136

Protein-specific immune response elicited by the Shigella sonnei 1790GAHB GMMA-based candidate vaccine in adults with varying exposure to Shigella.Randall, A. Z. Conti, V. Nakakana, U. Liang, X. Teng, A. A. Di Pasquale, A. L. Kapulu, M. Frenck, R, Jr. Launay, O. Ferruzzi, P. Scire, A. S. Marchetti, E. Obiero, C. Pablo, J. V. Edgar, J. Bejon, P. Shandling, A. D. Campo, J. J. Yee, A. Martin, L. B. Podda, A. Micoli, F.
mSphere, (2025). 10:e0105724

Identification of coxsackievirus A24 variant during an acute hemorrhagic conjunctivitis outbreak in coastal Kenya, 2024.Lambisia, A. W. Mwita Morobe, J. Moraa, E. Mwarumba, S. Korir, F. K. N. Seif Athman, R. Kiptui, R. Mbee, M. Mugo, N. Amoth, P. Muange, P. J. Houldcroft C Barasa, E. Mwangangi, J. Githinji, G. C. Holmes E Ochola-Oyier, L. I. Agoti, C. N.
Wellcome Open Res, (2025). 10:28

Insecticide resistance intensity in Anopheles gambiae (s.l.) from five malaria epidemiological zones in Kenya.Ramaita, E. Agumba, S. Mwangangi, J. Kitur, S. Wachira, L. Otieno, S. Mburu, D. Matoke-Muhia, D. Juma, E. Mbogo, C. Ochomo, E. Kamau, L.
Curr Res Parasitol Vector Borne Dis, (2025). 7:100252

Plasmodium falciparum reticulocyte-binding homologues are targets of human inhibitory antibodies and play a role in immune evasion.Reiling, L. Persson, K. E. M. McCallum, F. J. Gicheru, N. Kinyanjui, S. M. Chitnis, C. E. Fowkes, F. J. I. Marsh, K. Beeson, J. G.
Front Immunol, (2025). 16:1532451

Rethinking the evidence on COVID-19 in Africa.Bejon, P. Agweyu, A. Ochola-Oyier, L. I. Hamaluba, M. Kamuya, D. Kinyanjui, S. Barasa, E.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:e463-e471

Multiple insecticide resistance in Anopheles funestus from Mopeia, Central Mozambique.Kiuru, C. Constantino, L. Cole, G. Karisa, J. Wanjiku, C. Okoko, M. Candrinho, B. Saute, F. Rabinovich, N. R. Chaccour, C. Maia, M. F.
Malar J, (2025). 24:81

Through the eyes of the participant: using photovoice to understand the experiences and effects of ivermectin MDA in the context of the BOHEMIA clinical trial in Kwale, Kenya.Onyango, T. Nuru, K. Kazungu, K. Wangari, W. Chaccour, C. Regina Rabinovich, N. Mwangangi, J. Maia, M. Jones, C.
Malar J, (2025). 24:79

Development of an oral regimen of unithiol for the treatment of snakebite envenoming: a phase 1 open-label dose-escalation safety trial and pharmacokinetic analysis in healthy Kenyan adults.Abouyannis, M. Nyambura, Y. K. Ngome, S. Riako, D. Musyoki, J. Muiruri, C. Orindi, B. Else, L. Amara, A. Dickinson, L. Clare, R. H. Albulescu, L. O. Westhorpe, A. P. Kool, J. Adetifa, I. Ndungu, F. M. FitzGerald, R. Khoo, S. Lalloo, D. G. Casewell, N. R. Hamaluba, M.
EBioMedicine, (2025). 113:105600

Low-Dose Yellow Fever Vaccine in Adults in Africa.Kimathi, D. Juan-Giner, A. Bob, N. S. Orindi, B. Namulwana, M. L. Diatta, A. Cheruiyot, S. Fall, G. Dia, M. Hamaluba, M. M. Nyehangane, D. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Omuoyo, D. O. Hussein, M. Oloo, E. Kamau, N. Wafula, J. Bendera, J. Silvester, N. Mwavita, J. Joshua, M. Mwendwa, J. Agababyona, C. Ngetsa, C. Aisha, N. Moki, F. Buluku, T. Munene, M. Mwanga-Amumpaire, J. Lutwama, J. Kayiwa, J. Kamaara, E. Barrett, A. D. Kaleebu, P. Bejon, P. Sall, A. A. Grais, R. F. Warimwe, G. M. Nifty Investigators
N Engl J Med, (2025). 392:788-797

Beyond mosquitoes and malaria-ivermectin in Africa.Hammann, F. Maia, M. F.
Lancet Infect Dis, (2025). 25:703-705

Detection of low frequency artemisinin resistance mutations, C469Y, P553L and A675V, and fixed antifolate resistance mutations in asymptomatic primary school children in Kenya.Osoti, V. Wamae, K. Ndwiga, L. Gichuki, P. M. Okoyo, C. Kepha, S. Keitany, K. Kandie, R. Aricha, S. Kiplagat, R. Mwandawiro, C. Bejon, P. Snow, R. W. Ochola-Oyier, L. I.
BMC Infect Dis, (2025). 25:73

Regional action needed to halt antimalarial drug resistance in Africa.Martinez-Vega, R. Ishengoma, D. S. Gosling, R. Rosenthal, P. J. Dondorp, A. Barnes, K. I. Nsanzabana, C. Djimde, A. A. Ochola-Oyier, L. I. Tibenderana, J. Chimumbwa, J. Golassa, L. Kapologwe, N. A. Mbacham, W. F. Kamya, M. R. Fidock, D. A. Komatsu, R. von Seidlein, L. Dhorda, M.
Lancet, (2025). 405:7-10