Publications

Philip Bejon

SARS-CoV-2 seroprevalence and implications for population immunity: Evidence from two Health and Demographic Surveillance System sites in Kenya, February-December 2022.Kagucia, E. W. Ziraba, A. K. Nyagwange, J. Kutima, B. Kimani, M. Akech, D. Ng'oda, M. Sigilai, A. Mugo, D. Karanja, H. Gitonga, J. Karani, A. Toroitich, M. Karia, B. Otiende, M. Njeri, A. Aman, R. Amoth, P. Mwangangi, M. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Voller, S. Ochola-Oyier, L. I. Bottomley, C. Nyaguara, A. Munywoki, P. K. Bigogo, G. Maitha, E. Uyoga, S. Gallagher, K. E. Etyang, A. O. Barasa, E. Mwangangi, J. Bejon, P. Adetifa, I. M. O. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G. Agweyu, A.
Influenza Other Respir Viruses, (2023). 17:e13173

National prevalence and risk factors for tungiasis in Kenya.Elson, L. Kamau, C. Koech, S. Muthama, C. Gachomba, G. Sinoti, E. Chondo, E. Mburu, E. Wakio, M. Lore, J. Maia, M. Adetifa, I. Orindi, B. Bejon, P. Fillinger, U.
Infect Dis Poverty, (2023). 12:85

New SARS-CoV-2 Omicron Variant with Spike Protein Mutation Y451H, Kilifi, Kenya, March-May 2023.Mwanga, M. J. Lambisia, A. W. Morobe, J. M. Murunga, N. Moraa, E. Ndwiga, L. Cheruiyot, R. Musyoki, J. Mutunga, M. Guzman-Rincon, L. M. Sande, C. Mwangangi, J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Nokes, D. J. Agoti, C. N. Nyiro, J. Githinji, G.
Emerg Infect Dis, (2023). 29:2376-2379

The Dantu blood group prevents parasite growth in vivo: Evidence from a controlled human malaria infection study.Kariuki, S. N. Macharia, A. W. Makale, J. Nyamu, W. Hoffman, S. L. Kapulu, M. C. Bejon, P. Rayner, J. C. Williams, T. N. Chmi-Sika Study Team
Elife, (2023). 12:

Correlations between three ELISA protocols measurements of RTS,S/AS01-induced anti-CSP IgG antibodies.Mugo, R. M. Orindi, B. Shee, F. M. Bellamy, D. Mwacharo, J. Ewer, K. J. Bejon, P. Ndungu, F. M.
PLoS One, (2023). 18:e0286117

Immunogenicity and safety of fractional doses of 17D-213 yellow fever vaccine in children (YEFE): a randomised, double-blind, non-inferiority substudy of a phase 4 trial.Juan-Giner, A. Namulwana, M. L. Kimathi, D. Grantz, K. H. Fall, G. Dia, M. Bob, N. S. Sall, A. A. Nerima, C. Sahani, M. K. Mulogo, E. M. Ampeire, I. Hombach, J. Nanjebe, D. Mwanga-Amumpaire, J. Cummings, D. A. T. Bejon, P. Warimwe, G. M. Grais, R. F.
Lancet Infect Dis, (2023). 23:965-973

Immunogenicity and safety of fractional doses of 17D-213 yellow fever vaccine in HIV-infected people in Kenya (YEFE): a randomised, double-blind, non-inferiority substudy of a phase 4 trial.Kimathi, D. Juan-Giner, A. Orindi, B. Grantz, K. H. Bob, N. S. Cheruiyot, S. Hamaluba, M. Kamau, N. Fall, G. Dia, M. Mosobo, M. Moki, F. Kiogora, K. Chirro, O. Thiong'o, A. Mwendwa, J. Guantai, A. Karanja, H. K. Gitonga, J. Mugo, D. Ramko, K. Faye, O. Sanders, E. J. Grais, R. F. Bejon, P. Warimwe, G. M.
Lancet Infect Dis, (2023). 23:974-982

Spatial heterogeneity of low-birthweight deliveries on the Kenyan coast.Musau, M. M. Mwakio, S. Amadi, D. Nyaguara, A. Bejon, P. Berkley, J. A. Snow, R. W. Kamau, A.
BMC Pregnancy Childbirth, (2023). 23:270

Plasmodium falciparum adapts its investment into replication versus transmission according to the host environment.Abdi, A. I. Achcar, F. Sollelis, L. Silva-Filho, J. L. Mwikali, K. Muthui, M. Mwangi, S. Kimingi, H. W. Orindi, B. Andisi Kivisi, C. Alkema, M. Chandrasekar, A. Bull, P. C. Bejon, P. Modrzynska, K. Bousema, T. Marti, M.
Elife, (2023). 12:

Pf7: an open dataset of Plasmodium falciparum genome variation in 20,000 worldwide samples.MalariaGen, Abdel Hamid, M. M. Abdelraheem, M. H. Acheampong, D. O. Ahouidi, A. Ali, M. Almagro-Garcia, J. Amambua-Ngwa, A. Amaratunga, C. Amenga-Etego, L. Andagalu, B. Anderson, T. Andrianaranjaka, V. Aniebo, I. Aninagyei, E. Ansah, F. Ansah, P. O. Apinjoh, T. Arnaldo, P. Ashley, E. Auburn, S. Awandare, G. A. Ba, H. Baraka, V. Barry, A. Bejon, P. Bertin, G. I. Boni, M. F. Borrmann, S. Bousema, T. Bouyou-Akotet, M. Branch, O. Bull, P. C. Cheah, H. Chindavongsa, K. Chookajorn, T. Chotivanich, K. Claessens, A. Conway, D. J. Corredor, V. Courtier, E. Craig, A. D'Alessandro, U. Dama, S. Day, N. Denis, B. Dhorda, M. Diakite, M. Djimde, A. Dolecek, C. Dondorp, A. Doumbia, S. Drakeley, C. Drury, E. Duffy, P. Echeverry, D. F. Egwang, T. G. Enosse, S. M. M. Erko, B. Fairhurst, R. M. Faiz, A. Fanello, C. A. Fleharty, M. Forbes, M. Fukuda, M. Gamboa, D. Ghansah, A. Golassa, L. Goncalves, S. Harrison, G. L. A. Healy, S. A. Hendry, J. A. Hernandez-Koutoucheva, A. Hien, T. T. Hill, C. A. Hombhanje, F. Hott, A. Htut, Y. Hussein, M. Imwong, M. Ishengoma, D. Jackson, S. A. Jacob, C. G. Jeans, J. Johnson, K. J. Kamaliddin, C. Kamau, E. Keatley, J. Kochakarn, T. Konate, D. S. Konate, A. Kone, A. Kwiatkowski, D. P. Kyaw, M. P. Kyle, D. Lawniczak, M. Lee, S. K. Lemnge, M. Lim, P. Lon, C. Loua, K. M. Mandara, C. I. Marfurt, J. Marsh, K. Maude, R. J. Mayxay, M. Maiga-Ascofare, O. Miotto, O. Mita, T. Mobegi, V. Mohamed, A. O. Mokuolu, O. A. Montgomery, J. Morang'a, C. M. Mueller, I. Murie, K. Newton, P. N. Ngo Duc, T. Nguyen, T. Nguyen, T. N. Nguyen Thi Kim, T. Nguyen Van, H. Noedl, H. Nosten, F. Noviyanti, R. Ntui, V. N. Nzila, A. Ochola-Oyier, L. I. Ocholla, H. Oduro, A. Omedo, I. Onyamboko, M. A. Ouedraogo, J. B. Oyebola, K. Oyibo, W. A. Pearson, R. Peshu, N. Phyo, A. P. Plowe, C. V. Price, R. N. Pukrittayakamee, S. Quang, H. H. Randrianarivelojosia, M. Rayner, J. C. Ringwald, P. Rosanas-Urgell, A. Rovira-Vallbona, E. Ruano-Rubio, V. Ruiz, L. Saunders, D. Shayo, A. Siba, P. Simpson, V. J. Sissoko, M. S. Smith, C. Su, X. Z. Sutherland, C. Takala-Harrison, S. Talman, A. Tavul, L. Thanh, N. V. Thathy, V. Thu, A. M. Toure, M. Tshefu, A. Verra, F. Vinetz, J. Wellems, T. E. Wendler, J. White, N. J. Whitton, G. Yavo, W. van der Pluijm, R. W.
Wellcome Open Res, (2023). 8:22

Validation of saline, PBS and a locally produced VTM at varying storage conditions to detect the SARS-CoV-2 virus by qRT-PCR.Ngetsa, C. Osoti, V. Okanda, D. Marura, F. Shah, K. Karanja, H. Mugo, D. Gitonga, J. Mutunga, M. Lewa, C. Orindi, B. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I.
PLoS One, (2023). 18:e0280685

Anti-merozoite antibodies induce natural killer cell effector function and are associated with immunity against malaria.Odera, D. O. Tuju, J. Mwai, K. Nkumama, I. N. Furle, K. Chege, T. Kimathi, R. Diehl, S. Musasia, F. K. Rosenkranz, M. Njuguna, P. Hamaluba, M. Kapulu, M. C. Frank, R. Chmi-Sika Study Team Osier, F. H. A. Abdi, A. I. Chi, P. C. de Laurent, Z. Jao, I. Kamuya, D. Kamuyu, G. Makale, J. Murungi, L. Musyoki, J. Muthui, M. Mwacharo, J. Kariuki, S. Mwanga, D. Mwongeli, J. Ndungu, F. Njue, M. Nyangweso, G. Kimani, D. Ngoi, J. M. Musembi, J. Ngoto, O. Otieno, E. Ooko, M. Shangala, J. Wambua, J. Mohammed, K. S. Omuoyo, D. Mosobo, M. Kibinge, N. Kinyanjui, S. Bejon, P. Lowe, B. Marsh, K. Marsh, V. Abebe, Y. Billingsley, P. F. Sim, B. K. L. Hoffman, S. L. James, E. R. Richie, T. L. Audi, A. Olewe, F. Oloo, J. Ongecha, J. Ongas, M. O. Koskei, N. Bull, P. C. Hodgson, S. H. Kivisi, C. Imwong, M. Murphy, S. C. Ogutu, B. Tarning, J. Winterberg, M. Williams, T. N.
Sci Transl Med, (2023). 15:eabn5993

Serum immunoglobulin G and mucosal immunoglobulin A antibodies from prepandemic samples collected in Kilifi, Kenya, neutralize SARS-CoV-2 in vitro.Nyagwange, J. Kutima, B. Mwai, K. Karanja, H. K. Gitonga, J. N. Mugo, D. Sein, Y. Wright, D. Omuoyo, D. O. Nyiro, J. U. Tuju, J. Nokes, D. J. Agweyu, A. Bejon, P. Ochola-Oyier, L. I. Scott, J. A. G. Lambe, T. Nduati, E. Agoti, C. Warimwe, G. M.
Int J Infect Dis, (2023). 127:11-16

Impact of Intermittent Presumptive Treatment for Malaria in Pregnancy on Hospital Birth Outcomes on the Kenyan Coast.Kamau, A. Musau, M. Mwakio, S. Amadi, D. Nyaguara, A. Bejon, P. Seale, A. C. Berkley, J. A. Snow, R. W.
Clin Infect Dis, (2023). 76:e875-e883

A pragmatic randomized controlled trial of standard care versus corticosteroids plus standard care for treatment of pneumonia in adults admitted to Kenyan hospitals (SONIA).Lucinde, R. Abdi, A. Orindi, B. Mwakio, S. Gathuri, H. Onyango, E. Chira, S. Ogero, M. Isaaka, L. Shangala, J. Oginga, I. N. Wachira, A. Manuthu, E. Kariuki, H. Nyikuli, J. Wekesa, C. Otedo, A. Bosire, H. Okoth, S. B. Ongalo, W. Mukabi, D. Lusamba, W. Muthui, B. Kirui, N. Adembesa, I. Mithi, C. Sood, M. Ahmed, N. Gituma, B. Ongaki, V. B. Giabe, M. Omondi, C. Ombajo, L. A. Kagucia, W. English, M. Hamaluba, M. Ochola-Oyier, L. I. Kamuya, D. Bejon, P. Agweyu, A. Akech, S. Etyang, A. O.
Wellcome Open Res, (2022). 7:269

The CINAMR (Clinical Information Network-Antimicrobial Resistance) Project: A pilot microbial surveillance using hospitals linked to regional laboratories in Kenya: Study Protocol.Akech, S. Nyamwaya, B. Gachoki, J. Ogero, M. Kigo, J. Maina, M. Mutua, E. Ooko, E. Bejon, P. Mwarumba, S. Bahati, F. Mvera, B. Musyimi, R. Onsare, R. Hutter, J. Tanui, E. Wesangula, E. Turner, P. Dunachie, S. Lucey, O. McKnight, J. Cinamr Investigators
Wellcome Open Res, (2022). 7:256

Targeted amplicon deep sequencing of ama1 and mdr1 to track within-host P. falciparum diversity throughout treatment in a clinical drug trial.Wamae, K. Ndwiga, L. Kharabora, O. Kimenyi, K. Osoti, V. de Laurent, Z. Wambua, J. Musyoki, J. Ngetsa, C. Kalume, P. Mwambingu, G. Hamaluba, M. van der Pluijm, R. Dondorp, A. M. Bailey, J. Juliano, J. Bejon, P. Ochola-Oyier, L.
Wellcome Open Res, (2022). 7:95

SARS-CoV-2 seroprevalence in three Kenyan health and demographic surveillance sites, December 2020-May 2021.Etyang, A. O. Adetifa, I. Omore, R. Misore, T. Ziraba, A. K. Ng'oda, M. A. Gitau, E. Gitonga, J. Mugo, D. Kutima, B. Karanja, H. Toroitich, M. Nyagwange, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Aman, R. Amoth, P. Mwangangi, M. Kasera, K. Ng'ang'a, W. Akech, D. Sigilai, A. Karia, B. Karani, A. Voller, S. Agoti, C. N. Ochola-Oyier, L. I. Otiende, M. Bottomley, C. Nyaguara, A. Uyoga, S. Gallagher, K. Kagucia, E. W. Onyango, D. Tsofa, B. Mwangangi, J. Maitha, E. Barasa, E. Bejon, P. Warimwe, G. M. Scott, J. A. G. Agweyu, A.
PLOS Glob Public Health, (2022). 2:e0000883

The global burden of Chikungunya fever among children: A systematic literature review and meta-analysis.Nyamwaya, D. K. Thumbi, S. M. Bejon, P. Warimwe, G. M. Mokaya, J.
PLOS Glob Public Health, (2022). 2:e0000914

Sero-surveillance for IgG to SARS-CoV-2 at antenatal care clinics in three Kenyan referral hospitals: Repeated cross-sectional surveys 2020-21.Lucinde, R. K. Mugo, D. Bottomley, C. Karani, A. Gardiner, E. Aziza, R. Gitonga, J. N. Karanja, H. Nyagwange, J. Tuju, J. Wanjiku, P. Nzomo, E. Kamuri, E. Thuranira, K. Agunda, S. Nyutu, G. Etyang, A. O. Adetifa, I. M. O. Kagucia, E. Uyoga, S. Otiende, M. Otieno, E. Ndwiga, L. Agoti, C. N. Aman, R. A. Mwangangi, M. Amoth, P. Kasera, K. Nyaguara, A. Ng'ang'a, W. Ochola, L. B. Namdala, E. Gaunya, O. Okuku, R. Barasa, E. Bejon, P. Tsofa, B. Ochola-Oyier, L. I. Warimwe, G. M. Agweyu, A. Scott, J. A. G. Gallagher, K. E.
PLoS One, (2022). 17:e0265478